More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0039 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 420 aa  808    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  77.34 
 
 		 423 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  82 
 
 		 415 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  66.99 
 
 		 422 aa  519  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  72.66 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  70.83 
 
 		 417 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  65.22 
 
 		 421 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  50 
 
 		 420 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 440 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  46.13 
 
 		 411 aa  332  8e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  46.32 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  47.09 
 
 		 411 aa  327  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 		 417 aa  319  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 402 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  39.21 
 
 		 414 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  34.08 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 405 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  26.6 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  26.26 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  26.26 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  26.26 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  31.53 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  26.85 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  26.85 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  27.3 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  27.3 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  27.3 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  27.3 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  27.3 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.78 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  24.28 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  24.48 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  24.64 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  24.29 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1472  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  24 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  28.37 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  26.6 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  23.43 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  25.36 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0414  fosmidomycin resistance protein  29.53 
 
 		 248 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>