40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3526 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  100 
 
 		 233 aa  475  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  41.07 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8221  type IV secretion system protein VirB8  42.41 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  30.32 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  29.07 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  29.65 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  28.38 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  29.46 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  30.37 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  27.23 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  29.17 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  29.17 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  26.2 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  25.32 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  23.72 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  27.11 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  24.89 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  30.93 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  27.8 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  25.22 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  30.36 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  23.26 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  27.23 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  24.52 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  25.57 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  24.44 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  26.64 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  25.31 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  22.07 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  25.94 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  25.76 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  25.76 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  25.23 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  24.75 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0001  VirB8  25.91 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  25.47 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  25.24 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  26.63 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  23.53 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  24.17 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>