More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2564 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
423 aa  820    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  50.12 
 
 
424 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  51.54 
 
 
432 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  50.89 
 
 
427 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  51.28 
 
 
476 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  53.53 
 
 
424 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  45.26 
 
 
426 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  44.93 
 
 
416 aa  353  2.9999999999999997e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  50 
 
 
424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  47.54 
 
 
432 aa  352  8e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  42.93 
 
 
431 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  43.93 
 
 
413 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  42.37 
 
 
417 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  45.84 
 
 
423 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  42.86 
 
 
417 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  40.52 
 
 
433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  44.79 
 
 
425 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  39.72 
 
 
435 aa  316  6e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  44.58 
 
 
426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  46.14 
 
 
422 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  43 
 
 
412 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  40.14 
 
 
427 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  41.12 
 
 
418 aa  249  9e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  33.66 
 
 
409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  33.99 
 
 
409 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  34.13 
 
 
411 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  34.77 
 
 
411 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  33.25 
 
 
409 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  35.1 
 
 
500 aa  227  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  38.19 
 
 
442 aa  226  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  35.34 
 
 
414 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  39.24 
 
 
492 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  35.38 
 
 
496 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  33.42 
 
 
485 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  34.78 
 
 
474 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  29.67 
 
 
484 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  32.02 
 
 
536 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  29.37 
 
 
485 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.11 
 
 
509 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  27.71 
 
 
505 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  27.8 
 
 
493 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  28.17 
 
 
510 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  26.46 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  26.46 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  25.11 
 
 
487 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.13 
 
 
500 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  26.74 
 
 
548 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  26.23 
 
 
484 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  27.78 
 
 
496 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  25.62 
 
 
495 aa  80.5  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  26.73 
 
 
486 aa  79.7  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  27.11 
 
 
490 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  24.84 
 
 
496 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  27.11 
 
 
490 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  26.81 
 
 
481 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  27.11 
 
 
490 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  27.11 
 
 
490 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  26.12 
 
 
485 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  27.99 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  25.34 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  25.98 
 
 
508 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  27.74 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  27.74 
 
 
506 aa  77.8  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  27.11 
 
 
493 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  27.11 
 
 
493 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  27.11 
 
 
493 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  24.15 
 
 
494 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  27.31 
 
 
496 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  21.78 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  25.87 
 
 
508 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  21.78 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  26.74 
 
 
524 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  26.26 
 
 
493 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  25.73 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  26.36 
 
 
494 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  26.36 
 
 
494 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  25.63 
 
 
491 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  25.22 
 
 
485 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  21.25 
 
 
506 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  24.07 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  25.67 
 
 
486 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  23.41 
 
 
486 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  22.13 
 
 
503 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  23.65 
 
 
528 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  24.01 
 
 
489 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  25.73 
 
 
495 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  25.86 
 
 
510 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  27.66 
 
 
502 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  25.39 
 
 
482 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  27.44 
 
 
496 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  26.54 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  27.95 
 
 
498 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  24.66 
 
 
483 aa  72  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  20.54 
 
 
496 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  28.23 
 
 
526 aa  71.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  26.06 
 
 
488 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  25.68 
 
 
521 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  25.78 
 
 
484 aa  70.1  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  19.38 
 
 
511 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  22.79 
 
 
499 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>