More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  100 
 
 		 496 aa  978    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  52.29 
 
 		 492 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  46.82 
 
 		 536 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  43.52 
 
 		 474 aa  336  7e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  35.28 
 
 		 484 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  36.67 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  37.06 
 
 		 426 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  39.01 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  40.75 
 
 		 476 aa  231  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  39.2 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  35.22 
 
 		 432 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  34.55 
 
 		 435 aa  206  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  36.45 
 
 		 427 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  33.41 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  34.34 
 
 		 416 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  35.38 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  31.24 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  31.63 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  31.24 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  30.84 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  33.8 
 
 		 426 aa  172  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  35.93 
 
 		 424 aa  169  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  35.33 
 
 		 424 aa  169  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  34.73 
 
 		 423 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  34.28 
 
 		 422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  32.03 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  29.07 
 
 		 409 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  31.62 
 
 		 427 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  29.01 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  29.01 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  30.23 
 
 		 500 aa  145  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  28.69 
 
 		 497 aa  139  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  31.57 
 
 		 496 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  31.34 
 
 		 502 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  31.47 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  30.09 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  30.97 
 
 		 418 aa  136  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  28.23 
 
 		 502 aa  134  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.24 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26.24 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  31.59 
 
 		 498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  26.17 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  23.11 
 
 		 496 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  29.65 
 
 		 548 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.94 
 
 		 496 aa  126  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  30.49 
 
 		 498 aa  127  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.14 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  30.63 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  30.94 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  27.44 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  29.1 
 
 		 524 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  28.57 
 
 		 530 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.75 
 
 		 511 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.75 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  27.51 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  28.67 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  29.44 
 
 		 498 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  27.61 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  28.44 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  29.86 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.72 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  26.05 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  24.24 
 
 		 503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0150  gluconate kinase  26.48 
 
 		 427 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.731797  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  29.81 
 
 		 481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.6 
 
 		 499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  24.74 
 
 		 502 aa  117  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  26.33 
 
 		 518 aa  117  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  25.83 
 
 		 513 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.05 
 
 		 513 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  26.05 
 
 		 513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.17 
 
 		 513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  26.05 
 
 		 513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  28.81 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  26.05 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  25.83 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  29.95 
 
 		 506 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  28.48 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  26.05 
 
 		 512 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  24.65 
 
 		 509 aa  114  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  26.61 
 
 		 499 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.79 
 
 		 509 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  25.5 
 
 		 512 aa  113  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  25.36 
 
 		 518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  25.41 
 
 		 509 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  26.01 
 
 		 519 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  25.37 
 
 		 509 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  23.66 
 
 		 490 aa  110  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  27.2 
 
 		 484 aa  110  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  29.98 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  23.06 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  27.88 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  27.58 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  25.34 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  28.33 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  28.34 
 
 		 484 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  29.8 
 
 		 492 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  27.75 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  28.64 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  27.95 
 
 		 519 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>