More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2462 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  100 
 
 		 426 aa  862    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  53.29 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  54.78 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  52.78 
 
 		 416 aa  405  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  52.08 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  49.05 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  51.59 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  51.2 
 
 		 423 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  48.23 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  43.53 
 
 		 432 aa  316  6e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  45.23 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  44.58 
 
 		 423 aa  309  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  44.84 
 
 		 432 aa  308  8e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  43.53 
 
 		 424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  41.78 
 
 		 426 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  43.09 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  41.5 
 
 		 427 aa  282  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  40.24 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  41.31 
 
 		 476 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  42.48 
 
 		 418 aa  265  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  38.76 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  38.92 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  40.1 
 
 		 425 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  39.12 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  35.47 
 
 		 409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  34.24 
 
 		 409 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  37.39 
 
 		 500 aa  231  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  33.99 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  34.38 
 
 		 411 aa  226  9e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  34.47 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  34.38 
 
 		 414 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  30.91 
 
 		 484 aa  179  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  33.8 
 
 		 496 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  32.87 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  31.41 
 
 		 474 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  29.09 
 
 		 485 aa  149  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  30.68 
 
 		 536 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  24.89 
 
 		 494 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  24.21 
 
 		 518 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  27.75 
 
 		 515 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  24.28 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  22.66 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  25 
 
 		 510 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  26.54 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  22.98 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  25.83 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  23.44 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  23.54 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  22.15 
 
 		 530 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  25.66 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  23.66 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  25.84 
 
 		 493 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  21.52 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  25.29 
 
 		 502 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  24.78 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  24.59 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.12 
 
 		 500 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  24.88 
 
 		 496 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  26.14 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  22.05 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  24.02 
 
 		 502 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  23.41 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  25.56 
 
 		 498 aa  70.1  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  25.93 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  24.68 
 
 		 511 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  26.49 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  24.14 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  24.48 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  24 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  22.27 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  23.54 
 
 		 511 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  22.73 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  22.49 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  26.15 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  23.97 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  24.64 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  23.3 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  24.64 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  27.25 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  25.06 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  24.64 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  24.64 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  24.62 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  20.89 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  24.38 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  20.49 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  23.67 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  25.78 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  23.67 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  24.94 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  18.92 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  21.54 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  23.33 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  20.27 
 
 		 512 aa  63.5  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  24.11 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  24.28 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  21.33 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  24.4 
 
 		 485 aa  63.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  21.33 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>