284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2187 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
424 aa  805    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  50.75 
 
 
427 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  53.77 
 
 
423 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  50 
 
 
424 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  51.45 
 
 
476 aa  352  7e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  48.4 
 
 
432 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  42.79 
 
 
426 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  42.65 
 
 
431 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  49.53 
 
 
424 aa  312  6.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  42.86 
 
 
416 aa  310  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  46.51 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  41.99 
 
 
413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  45.9 
 
 
423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  39.13 
 
 
417 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  39.37 
 
 
417 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  48.67 
 
 
422 aa  300  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  44.6 
 
 
425 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  39.34 
 
 
435 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  38.12 
 
 
433 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  40.95 
 
 
426 aa  278  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  40.96 
 
 
418 aa  243  7e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  39.17 
 
 
427 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  40.41 
 
 
412 aa  236  8e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  33.58 
 
 
411 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  34.08 
 
 
411 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  34.68 
 
 
500 aa  211  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  30.81 
 
 
409 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  35.34 
 
 
414 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  37.56 
 
 
442 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  29.1 
 
 
409 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  29.83 
 
 
409 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  38.26 
 
 
474 aa  186  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  33.18 
 
 
484 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  34.46 
 
 
485 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  37.7 
 
 
492 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  37.3 
 
 
496 aa  160  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  35.23 
 
 
536 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  29.69 
 
 
491 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  28.98 
 
 
511 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  26.17 
 
 
494 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  27.82 
 
 
512 aa  80.1  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  29.02 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  28.44 
 
 
496 aa  79.7  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  29.71 
 
 
490 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  29.71 
 
 
490 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  29.49 
 
 
490 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  29.49 
 
 
490 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  23.38 
 
 
492 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  23.38 
 
 
492 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  26.45 
 
 
486 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  29.14 
 
 
548 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  28.01 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  29.38 
 
 
496 aa  73.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  28.4 
 
 
493 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  26.48 
 
 
495 aa  73.2  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  30.71 
 
 
474 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.06 
 
 
530 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  30.56 
 
 
474 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  28.48 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  25.94 
 
 
482 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  28.35 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  28.48 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  27.43 
 
 
474 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  28.03 
 
 
493 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  28.03 
 
 
493 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  25.87 
 
 
496 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.85 
 
 
500 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  30.32 
 
 
474 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  25.29 
 
 
502 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  28.47 
 
 
475 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  28.89 
 
 
493 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  28.13 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  28.47 
 
 
475 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  28.47 
 
 
475 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  28.89 
 
 
493 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  28.89 
 
 
493 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  28.47 
 
 
475 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  26.76 
 
 
489 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  27.12 
 
 
488 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  27.12 
 
 
488 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  27.8 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  28.37 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  28.4 
 
 
486 aa  67  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  28.85 
 
 
493 aa  67  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.83 
 
 
509 aa  66.6  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  28.37 
 
 
486 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  27.92 
 
 
488 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  28.37 
 
 
486 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  23.63 
 
 
519 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  29.62 
 
 
501 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  28.51 
 
 
481 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  26.4 
 
 
510 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  24.88 
 
 
484 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  24.11 
 
 
484 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1269  carbohydrate kinase FGGY  26.88 
 
 
512 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.237373  normal  0.4507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  26.88 
 
 
505 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  26.07 
 
 
493 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  24.64 
 
 
484 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  29.67 
 
 
526 aa  63.5  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.47 
 
 
530 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>