More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2493 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
474 aa  936    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  43.04 
 
 
484 aa  364  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  43.31 
 
 
485 aa  345  8e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  44.16 
 
 
496 aa  339  8e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  43.43 
 
 
492 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  38.01 
 
 
536 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  37.35 
 
 
426 aa  246  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  38.03 
 
 
424 aa  232  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  35.88 
 
 
416 aa  226  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  38.44 
 
 
432 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  36.81 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  36.13 
 
 
431 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  34.57 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  36.95 
 
 
476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  36.76 
 
 
427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  39.81 
 
 
432 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  34.5 
 
 
417 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  31.21 
 
 
433 aa  206  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  36.56 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  38 
 
 
422 aa  196  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  35.45 
 
 
423 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  33.26 
 
 
435 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  38.53 
 
 
424 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.57 
 
 
492 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.57 
 
 
492 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  38.05 
 
 
424 aa  176  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  33.1 
 
 
426 aa  170  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  31.86 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  31.99 
 
 
502 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  30.67 
 
 
500 aa  161  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.09 
 
 
518 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  29.09 
 
 
530 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  25.4 
 
 
490 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  25.45 
 
 
506 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  27.12 
 
 
500 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  32.78 
 
 
496 aa  153  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  32.15 
 
 
494 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  32.15 
 
 
494 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  30.82 
 
 
485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.39 
 
 
548 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.93 
 
 
501 aa  153  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  29.96 
 
 
484 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  34.33 
 
 
496 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  31.53 
 
 
510 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  31.77 
 
 
506 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.52 
 
 
504 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  34.18 
 
 
502 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  31.94 
 
 
494 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  32.11 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  28.27 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  32.18 
 
 
498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  31.43 
 
 
511 aa  148  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  29.58 
 
 
497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  29.22 
 
 
519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  33.86 
 
 
492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  29.6 
 
 
496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.28 
 
 
512 aa  147  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  33.79 
 
 
492 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  34.7 
 
 
492 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  27.27 
 
 
499 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  25.96 
 
 
511 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  28.9 
 
 
514 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  30.24 
 
 
524 aa  144  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  26.51 
 
 
509 aa  143  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  29.21 
 
 
515 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  29.17 
 
 
489 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  32.65 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  32.65 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  30.66 
 
 
509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  33.19 
 
 
492 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  27.96 
 
 
494 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  32.07 
 
 
478 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  25.79 
 
 
518 aa  141  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.03 
 
 
483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  31.48 
 
 
501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  31.03 
 
 
483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  27.29 
 
 
512 aa  140  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  32.59 
 
 
498 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  25.66 
 
 
486 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  28.99 
 
 
485 aa  140  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  26.15 
 
 
512 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  29.51 
 
 
484 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  28.81 
 
 
481 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  25.15 
 
 
496 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  27.51 
 
 
511 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  26.4 
 
 
512 aa  139  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  33.33 
 
 
480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.11 
 
 
497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  28.19 
 
 
499 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.67 
 
 
500 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  31.78 
 
 
478 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  28.9 
 
 
484 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  30.65 
 
 
487 aa  137  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  31.35 
 
 
510 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  31.39 
 
 
505 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2407  carbohydrate kinase, FGGY  28.48 
 
 
487 aa  136  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.242819  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.8 
 
 
509 aa  136  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  26.59 
 
 
409 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  26.05 
 
 
513 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  27.31 
 
 
502 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>