More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3223 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  100 
 
 		 424 aa  836    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  52.73 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  57.68 
 
 		 432 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  56.12 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  52.5 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  44.39 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  48.81 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  50.12 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  51.08 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  49.4 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  44.31 
 
 		 416 aa  343  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  43.91 
 
 		 431 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  45.52 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  43.9 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  40.61 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  41.57 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  43.47 
 
 		 413 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  42.04 
 
 		 417 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  46.19 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  43.53 
 
 		 426 aa  310  4e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  40.62 
 
 		 418 aa  263  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  39.62 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  38.9 
 
 		 412 aa  243  6e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  39.24 
 
 		 492 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  39.01 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  37.79 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  33.02 
 
 		 411 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  33.25 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  34.03 
 
 		 484 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  32.13 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  33.81 
 
 		 414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  35.7 
 
 		 500 aa  219  5e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  31.19 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  36.3 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  37.5 
 
 		 474 aa  216  8e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  31.26 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  35.6 
 
 		 536 aa  210  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  29.64 
 
 		 512 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  28.98 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  26.24 
 
 		 501 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  26.52 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  27.76 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.94 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  23.18 
 
 		 496 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  26.87 
 
 		 499 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  27.78 
 
 		 548 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.5 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.45 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.94 
 
 		 518 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  27.03 
 
 		 512 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  30.07 
 
 		 486 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.43 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.43 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  29.43 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  29.43 
 
 		 486 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  27.15 
 
 		 509 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  27.45 
 
 		 524 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  29.43 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  25.11 
 
 		 512 aa  98.2  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  26.02 
 
 		 488 aa  98.2  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  26.43 
 
 		 502 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  28.84 
 
 		 485 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  28.74 
 
 		 492 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  28.44 
 
 		 493 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  29.37 
 
 		 475 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  29.37 
 
 		 475 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  29.37 
 
 		 475 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  29.37 
 
 		 475 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  27.63 
 
 		 510 aa  96.7  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  27.85 
 
 		 490 aa  96.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  27.85 
 
 		 490 aa  96.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  28.54 
 
 		 496 aa  96.3  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  27.13 
 
 		 487 aa  96.3  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  27.85 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  27.85 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  28.04 
 
 		 498 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  24.61 
 
 		 509 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  29.45 
 
 		 498 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.61 
 
 		 509 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  28.04 
 
 		 493 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  28.31 
 
 		 496 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  27.92 
 
 		 492 aa  94  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  27.79 
 
 		 493 aa  93.2  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  28.32 
 
 		 493 aa  93.2  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  29.05 
 
 		 505 aa  93.6  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  26.7 
 
 		 493 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.7 
 
 		 496 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  27.85 
 
 		 505 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.98 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  28.1 
 
 		 493 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  28.1 
 
 		 493 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  28.1 
 
 		 493 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  28.89 
 
 		 498 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.1 
 
 		 511 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  27.17 
 
 		 510 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  25.84 
 
 		 508 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  28.94 
 
 		 488 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  28.94 
 
 		 488 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  28.02 
 
 		 502 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  22.52 
 
 		 506 aa  90.5  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>