More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2154 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 427 aa  841    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  52.03 
 
 		 424 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  50.84 
 
 		 424 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  50.72 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  50.59 
 
 		 476 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  50.35 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  44.89 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  46.1 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  47.69 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  45.73 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  45.06 
 
 		 413 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  39.63 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  42.24 
 
 		 416 aa  318  9e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  41.93 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  41.45 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  40.9 
 
 		 433 aa  310  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  41.93 
 
 		 431 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  41.94 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  41.77 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  43.47 
 
 		 422 aa  279  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  38.31 
 
 		 412 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  35.73 
 
 		 427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  34.53 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  37.38 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  33.81 
 
 		 411 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  32.05 
 
 		 409 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  35.35 
 
 		 500 aa  229  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  33.56 
 
 		 484 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  31.57 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  32.52 
 
 		 409 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  34.62 
 
 		 485 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  36.27 
 
 		 474 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  31.44 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  34.7 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  36.56 
 
 		 496 aa  196  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  36.85 
 
 		 492 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  37.3 
 
 		 536 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.68 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.68 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  26.07 
 
 		 518 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  26.97 
 
 		 488 aa  96.3  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  27.75 
 
 		 487 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  28.54 
 
 		 496 aa  94  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  22.94 
 
 		 496 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  28.57 
 
 		 494 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  28.57 
 
 		 494 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.89 
 
 		 500 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  26.52 
 
 		 508 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  28.44 
 
 		 494 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  28.41 
 
 		 485 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  28.54 
 
 		 487 aa  90.1  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  23.09 
 
 		 490 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  26.47 
 
 		 517 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  27.66 
 
 		 493 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  26.47 
 
 		 517 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.48 
 
 		 509 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  28.48 
 
 		 498 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  23.79 
 
 		 509 aa  87  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  26.77 
 
 		 511 aa  87  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  26.64 
 
 		 495 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  27.94 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  26.21 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  22.65 
 
 		 506 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  26.49 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  27.78 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  28.84 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  25.4 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  29.53 
 
 		 496 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  26.39 
 
 		 512 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  21.88 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  27.31 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  24.83 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  21.81 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  28.13 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  28.41 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  21.66 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  24.4 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  26.73 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  21.66 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  26.58 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.56 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  24.26 
 
 		 519 aa  80.9  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  22.97 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  28.08 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.89 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  27.07 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  25.74 
 
 		 530 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  26.81 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  26.81 
 
 		 548 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  28.03 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  28.03 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  30.38 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  26 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  24.35 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  26.93 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  25.79 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  28.03 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  23.26 
 
 		 513 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  24.57 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  27.25 
 
 		 490 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>