More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3503 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
484 aa  996    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  56.49 
 
 
485 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  43.04 
 
 
474 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  36.57 
 
 
492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  35.28 
 
 
496 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  34.19 
 
 
426 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  32.82 
 
 
536 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  35.9 
 
 
432 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  34.03 
 
 
424 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  33.41 
 
 
427 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  33.41 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  35.19 
 
 
476 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  32.71 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  34.19 
 
 
417 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  33.02 
 
 
413 aa  210  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  33.72 
 
 
417 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  31.78 
 
 
416 aa  208  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  31.24 
 
 
433 aa  207  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  33.02 
 
 
423 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  33.94 
 
 
425 aa  193  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  30.59 
 
 
435 aa  183  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  33.1 
 
 
424 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  33.18 
 
 
424 aa  181  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  30.91 
 
 
426 aa  179  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  32.49 
 
 
422 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  29.27 
 
 
423 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  28.69 
 
 
500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  28.77 
 
 
504 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  27.36 
 
 
502 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28.98 
 
 
496 aa  158  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.89 
 
 
498 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  28.04 
 
 
486 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  28.07 
 
 
530 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  27.03 
 
 
526 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.05 
 
 
518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  24.74 
 
 
499 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  29.2 
 
 
506 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  26.38 
 
 
489 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  27.88 
 
 
427 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.34 
 
 
512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.57 
 
 
509 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  27.7 
 
 
502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.42 
 
 
501 aa  148  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  26.63 
 
 
524 aa  146  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  28.05 
 
 
524 aa  146  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  29.05 
 
 
500 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  28.21 
 
 
409 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.55 
 
 
492 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  25.44 
 
 
511 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.73 
 
 
514 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.55 
 
 
492 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  26.33 
 
 
497 aa  144  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  25.44 
 
 
511 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  29.2 
 
 
515 aa  143  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  26.27 
 
 
488 aa  143  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  27.12 
 
 
513 aa  143  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  27.36 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  26.92 
 
 
513 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  28.27 
 
 
412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  24.12 
 
 
499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  25.25 
 
 
511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  29.49 
 
 
418 aa  141  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  27.69 
 
 
496 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  25.44 
 
 
511 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.71 
 
 
513 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  27.25 
 
 
411 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  28.34 
 
 
511 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.98 
 
 
509 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  27.78 
 
 
509 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  26.75 
 
 
513 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.75 
 
 
513 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  26.75 
 
 
513 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  26.63 
 
 
548 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  27.49 
 
 
502 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  29.14 
 
 
510 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  26.65 
 
 
513 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  28.6 
 
 
409 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  26.75 
 
 
513 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  25.65 
 
 
519 aa  136  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  27.27 
 
 
409 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  26.99 
 
 
512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  26.85 
 
 
511 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  27.18 
 
 
519 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  26.5 
 
 
505 aa  134  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  28.5 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  25.41 
 
 
509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  28.21 
 
 
501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  26.17 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  25.68 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  27.58 
 
 
493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  26.17 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  27.23 
 
 
485 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.9 
 
 
506 aa  131  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  26.84 
 
 
509 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  26.76 
 
 
505 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  26.93 
 
 
519 aa  130  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.74 
 
 
500 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  27.77 
 
 
442 aa  129  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.49 
 
 
489 aa  129  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  26.28 
 
 
517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>