More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4080 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
536 aa  1049    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  46.82 
 
 
496 aa  411  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  43.05 
 
 
492 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  37.23 
 
 
474 aa  262  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  36.21 
 
 
485 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  32.82 
 
 
484 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  35.6 
 
 
424 aa  207  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  33.26 
 
 
426 aa  203  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  36.34 
 
 
476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  37.47 
 
 
432 aa  200  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  36.9 
 
 
427 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  33.87 
 
 
425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  31.55 
 
 
423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  31.07 
 
 
435 aa  160  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  34.75 
 
 
524 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  33.72 
 
 
424 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  28.07 
 
 
417 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.25 
 
 
432 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  32.46 
 
 
502 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  31.02 
 
 
413 aa  150  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  34.62 
 
 
424 aa  148  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  28.07 
 
 
417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  32.02 
 
 
423 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  27.04 
 
 
431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  30.09 
 
 
416 aa  142  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  28.22 
 
 
500 aa  141  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  34.16 
 
 
472 aa  139  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  34.66 
 
 
422 aa  137  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  29.74 
 
 
497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  30.68 
 
 
426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  28.81 
 
 
500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  28.88 
 
 
509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  26.12 
 
 
433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  30.84 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  27.71 
 
 
511 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  27.78 
 
 
514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.66 
 
 
502 aa  127  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.42 
 
 
512 aa  127  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  29.2 
 
 
442 aa  126  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  29.12 
 
 
530 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.04 
 
 
548 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  26.99 
 
 
509 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  32.75 
 
 
492 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  31.93 
 
 
506 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  33.86 
 
 
498 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  31.3 
 
 
496 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.31 
 
 
499 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.33 
 
 
492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26.33 
 
 
492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  26.25 
 
 
501 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  32.58 
 
 
492 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  31.97 
 
 
501 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.36 
 
 
496 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  30.67 
 
 
506 aa  121  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  29.2 
 
 
427 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  31.83 
 
 
492 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  31.83 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  32.3 
 
 
506 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  31.83 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.6 
 
 
538 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  24.32 
 
 
503 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  30.77 
 
 
412 aa  118  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  30.86 
 
 
492 aa  118  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  30.79 
 
 
502 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.77 
 
 
506 aa  117  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.08 
 
 
511 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  28.51 
 
 
482 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  28.5 
 
 
481 aa  116  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  28.5 
 
 
484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  25.84 
 
 
512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  26.36 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  25.78 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  29.53 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.56 
 
 
504 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  29.08 
 
 
493 aa  115  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  24.06 
 
 
505 aa  114  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.4 
 
 
501 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  27.31 
 
 
499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.71 
 
 
500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  27.06 
 
 
488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  29.71 
 
 
505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  29.84 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  28.15 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  26.18 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  28.57 
 
 
496 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  25 
 
 
496 aa  111  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  31.24 
 
 
418 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  29.02 
 
 
438 aa  111  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  28.7 
 
 
508 aa  111  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  29.46 
 
 
489 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.52 
 
 
509 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  24.49 
 
 
509 aa  110  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  28.1 
 
 
509 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  25.89 
 
 
512 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  30.22 
 
 
492 aa  110  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  25.45 
 
 
511 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  25.45 
 
 
512 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  25.53 
 
 
409 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  29.26 
 
 
492 aa  110  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  31.03 
 
 
505 aa  110  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>