More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3132 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 485 aa  1000    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  56.49 
 
 		 484 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  43.42 
 
 		 474 aa  340  4e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  37.29 
 
 		 496 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  34.5 
 
 		 492 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  35.36 
 
 		 536 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  35.63 
 
 		 424 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  37.12 
 
 		 476 aa  215  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  33.41 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  34.62 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  32.79 
 
 		 426 aa  206  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  34.15 
 
 		 432 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  32.71 
 
 		 413 aa  193  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  32.87 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  32.4 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  29.67 
 
 		 416 aa  186  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  29.3 
 
 		 433 aa  183  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  31.25 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  29.47 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  32.79 
 
 		 422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  31.78 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  33.56 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  28.81 
 
 		 417 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  29.04 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  32.86 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.51 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.86 
 
 		 502 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.71 
 
 		 501 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.39 
 
 		 499 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  29.43 
 
 		 426 aa  157  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.6 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.37 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.37 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  31.79 
 
 		 512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.04 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  27.55 
 
 		 497 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  27.2 
 
 		 502 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.88 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  29.33 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.29 
 
 		 496 aa  144  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  28.17 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  28.31 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  29.92 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  27.96 
 
 		 548 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  26.8 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  29.59 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.81 
 
 		 498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  27.68 
 
 		 509 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  28.54 
 
 		 496 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  26.92 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  25.5 
 
 		 509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  27.59 
 
 		 502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  27.33 
 
 		 504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  25.87 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  28.96 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  25 
 
 		 500 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  28.72 
 
 		 500 aa  129  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  25.64 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  27.78 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  27.31 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.1 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  25 
 
 		 506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  26.43 
 
 		 513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.43 
 
 		 513 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  26.63 
 
 		 524 aa  126  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  25.4 
 
 		 511 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  26.21 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.21 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  26.21 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  26.21 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  25.7 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  24.03 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  25.49 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  28.94 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  26.5 
 
 		 489 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  25.35 
 
 		 511 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.71 
 
 		 506 aa  123  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  25.99 
 
 		 513 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  27.03 
 
 		 514 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  27.91 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  28.4 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.14 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  26.7 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  25.93 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  30.43 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  24.74 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  25 
 
 		 499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  26.82 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  27.34 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  26.09 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  25.61 
 
 		 509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  27.21 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  26.07 
 
 		 505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  25.66 
 
 		 512 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  27.8 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  26.75 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  25.05 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  24.37 
 
 		 514 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  26.51 
 
 		 482 aa  118  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  25.26 
 
 		 505 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>