More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8238 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
492 aa  964    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  52.29 
 
 
496 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  43.05 
 
 
536 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  42.8 
 
 
474 aa  323  5e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  37.17 
 
 
484 aa  300  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  35.25 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  39.24 
 
 
424 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  41.07 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  35.76 
 
 
426 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  39.95 
 
 
423 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  38.3 
 
 
432 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34.76 
 
 
432 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  36.79 
 
 
427 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  32.24 
 
 
416 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  33.18 
 
 
423 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  37.53 
 
 
424 aa  187  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  37.7 
 
 
424 aa  186  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  34.35 
 
 
425 aa  182  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  30.52 
 
 
417 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  31.06 
 
 
431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  33.1 
 
 
413 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  30.23 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  29.84 
 
 
417 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  31.78 
 
 
500 aa  172  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  31.51 
 
 
497 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  32.87 
 
 
426 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  31.15 
 
 
502 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  33.73 
 
 
524 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  29.26 
 
 
433 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  31.36 
 
 
427 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.47 
 
 
548 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  33.41 
 
 
422 aa  150  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  25.17 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  31.67 
 
 
506 aa  148  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  25.87 
 
 
409 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.88 
 
 
502 aa  143  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  25.87 
 
 
500 aa  141  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  32.16 
 
 
418 aa  140  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  33.1 
 
 
412 aa  139  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  25.35 
 
 
409 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.01 
 
 
512 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.62 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  30.74 
 
 
494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  29.05 
 
 
505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  30.72 
 
 
496 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.48 
 
 
538 aa  134  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.14 
 
 
509 aa  133  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  31.3 
 
 
494 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  31.3 
 
 
494 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  28.09 
 
 
414 aa  133  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  30.8 
 
 
502 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  33.53 
 
 
498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  31.06 
 
 
510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.64 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.64 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  27.2 
 
 
494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  27.12 
 
 
411 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  30.17 
 
 
485 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  26.67 
 
 
512 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  26.42 
 
 
411 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  28.48 
 
 
493 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  30.06 
 
 
498 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  25.2 
 
 
513 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  27.55 
 
 
512 aa  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  30.41 
 
 
508 aa  123  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  25.4 
 
 
513 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.4 
 
 
513 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  25.4 
 
 
513 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.56 
 
 
518 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.85 
 
 
509 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  29.68 
 
 
491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  24.06 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  29.92 
 
 
498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  25.4 
 
 
513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  29.21 
 
 
490 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  25.4 
 
 
513 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  29.21 
 
 
490 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.1 
 
 
499 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  29.21 
 
 
490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  29.21 
 
 
490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  29.65 
 
 
495 aa  120  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.05 
 
 
513 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  29.45 
 
 
493 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  30.32 
 
 
481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  28.9 
 
 
493 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  26.75 
 
 
505 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  27.67 
 
 
514 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  26.93 
 
 
495 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  30.16 
 
 
492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  24.8 
 
 
513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.14 
 
 
530 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  28.67 
 
 
493 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  28.18 
 
 
509 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28.63 
 
 
496 aa  117  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  25.35 
 
 
519 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  29.38 
 
 
442 aa  117  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  28.6 
 
 
510 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  29.46 
 
 
493 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  29.46 
 
 
493 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  29.46 
 
 
493 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>