More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1226 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  100 
 
 		 422 aa  835    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  49.64 
 
 		 417 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  49.76 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  49.15 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  51.92 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  50.24 
 
 		 416 aa  405  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  51.09 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  47.96 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  48.23 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  45.71 
 
 		 432 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  50.48 
 
 		 432 aa  335  9e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  45.95 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  45.05 
 
 		 426 aa  329  7e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  43.79 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  48.07 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  46.14 
 
 		 423 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  45.34 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  44.15 
 
 		 425 aa  295  9e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  45.22 
 
 		 476 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  43.47 
 
 		 427 aa  282  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  41.71 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  43.9 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  43.07 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  39.9 
 
 		 414 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  35.02 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  33.5 
 
 		 409 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  35.44 
 
 		 411 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  34.22 
 
 		 409 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  38.43 
 
 		 442 aa  231  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  35.7 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  33.5 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  32.57 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  36.5 
 
 		 474 aa  190  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  32.77 
 
 		 485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  34.28 
 
 		 496 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  34.66 
 
 		 536 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  33.41 
 
 		 492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  24.73 
 
 		 502 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  27.47 
 
 		 512 aa  87.4  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  25.76 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.85 
 
 		 500 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  27.7 
 
 		 512 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  25.44 
 
 		 499 aa  81.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  25.54 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  23.27 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  23.75 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  23.63 
 
 		 506 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  23.67 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  27.27 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  28.76 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3259  xylulokinase  27.15 
 
 		 533 aa  77  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  25.95 
 
 		 493 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  23.04 
 
 		 512 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  23.04 
 
 		 511 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  25.23 
 
 		 530 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  23.81 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  25 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  23.63 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0150  gluconate kinase  25.2 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.731797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  23.04 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  23.48 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  27.94 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  25.49 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  23.27 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  28.27 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  24.72 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  21.06 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  25.15 
 
 		 514 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  22.46 
 
 		 506 aa  73.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  29.07 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  24.27 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  29.07 
 
 		 493 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  25.45 
 
 		 511 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  24.27 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  24.01 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  26.67 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  27.39 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  27.68 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  23.79 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  25.11 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  23.79 
 
 		 511 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  25.11 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  22.05 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  26.77 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  24.6 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  21.59 
 
 		 500 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  27.73 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.09 
 
 		 548 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  22.17 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  26.19 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  27.5 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  26.86 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  26.39 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3151  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.75 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  23.63 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.38 
 
 		 497 aa  66.6  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  22.55 
 
 		 518 aa  66.2  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  27.79 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  23.65 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  25.17 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>