More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2020 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
476 aa  934    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  56.12 
 
 
424 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  50.59 
 
 
426 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  55.21 
 
 
432 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  51.28 
 
 
423 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  50.62 
 
 
427 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  50.36 
 
 
424 aa  363  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  47.37 
 
 
432 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  46.01 
 
 
425 aa  342  5.999999999999999e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  40.32 
 
 
435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  45.12 
 
 
423 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  48.07 
 
 
424 aa  329  7e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  42.69 
 
 
413 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  39.77 
 
 
431 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  40.94 
 
 
416 aa  321  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  38.06 
 
 
417 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  38.35 
 
 
433 aa  311  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  37.83 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  41.31 
 
 
426 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  45.22 
 
 
422 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  41.69 
 
 
412 aa  280  5e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  40.19 
 
 
427 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  41.71 
 
 
418 aa  266  4e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  40.84 
 
 
492 aa  236  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  40.75 
 
 
496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  35.19 
 
 
484 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  31.98 
 
 
409 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  31.35 
 
 
409 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  37.32 
 
 
485 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  30.9 
 
 
411 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  31.19 
 
 
411 aa  223  8e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  32.06 
 
 
409 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  33.49 
 
 
414 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  36.34 
 
 
536 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  38.37 
 
 
474 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  35.54 
 
 
442 aa  209  7e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  34.98 
 
 
500 aa  208  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  31.18 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  30.8 
 
 
502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  28.48 
 
 
496 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  28.57 
 
 
496 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  26.61 
 
 
482 aa  100  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  28 
 
 
498 aa  100  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  26.42 
 
 
487 aa  99.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  29.38 
 
 
508 aa  99.8  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  28.54 
 
 
485 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3072  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.16 
 
 
556 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.317516  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  27.38 
 
 
490 aa  97.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  25.83 
 
 
494 aa  97.4  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  27.38 
 
 
490 aa  97.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  27.03 
 
 
485 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  27.38 
 
 
490 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  27.38 
 
 
490 aa  97.1  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  27.99 
 
 
498 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  24.72 
 
 
483 aa  96.3  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  27.75 
 
 
512 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  26.58 
 
 
485 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  29.28 
 
 
492 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  28.44 
 
 
510 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  29.46 
 
 
481 aa  95.5  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.58 
 
 
511 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  23.01 
 
 
492 aa  95.1  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  26.73 
 
 
494 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  28.63 
 
 
492 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  23.01 
 
 
492 aa  95.1  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  27.21 
 
 
493 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  27.62 
 
 
530 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.18 
 
 
548 aa  94  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  28.63 
 
 
492 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  28.63 
 
 
492 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  26.1 
 
 
484 aa  93.2  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  27.17 
 
 
491 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  28.61 
 
 
512 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  28.02 
 
 
498 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  22.94 
 
 
518 aa  92.8  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  27.23 
 
 
493 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  27.1 
 
 
486 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.23 
 
 
500 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  26.79 
 
 
505 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  25.5 
 
 
519 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  27.61 
 
 
478 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  29.24 
 
 
504 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  27.11 
 
 
520 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  26.8 
 
 
493 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  26.8 
 
 
493 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  26.8 
 
 
493 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  26.68 
 
 
486 aa  89.7  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  25.11 
 
 
499 aa  89.7  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  26.7 
 
 
519 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  29.65 
 
 
524 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  25.36 
 
 
495 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  26.2 
 
 
496 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  32.31 
 
 
508 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  28.12 
 
 
492 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  28.02 
 
 
492 aa  88.6  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  26.24 
 
 
484 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  24.61 
 
 
514 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  25.05 
 
 
484 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  26 
 
 
484 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  25.93 
 
 
519 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>