More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1524 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  100 
 
 
196 aa  384  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  48.85 
 
 
216 aa  161  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  44.39 
 
 
192 aa  161  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  50 
 
 
238 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  44.44 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  47.13 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  47.62 
 
 
221 aa  138  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  51.25 
 
 
235 aa  138  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  54.61 
 
 
234 aa  136  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  48.41 
 
 
219 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  44.68 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  44.9 
 
 
196 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  47.4 
 
 
208 aa  134  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  50.99 
 
 
213 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  44.37 
 
 
200 aa  134  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  50 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  43.62 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  50 
 
 
235 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  45.11 
 
 
187 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  47.68 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  40.93 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  40.93 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  40.11 
 
 
193 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  40.4 
 
 
153 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  48.03 
 
 
247 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  47.68 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  47.68 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  41.86 
 
 
196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  47.02 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  46.36 
 
 
190 aa  118  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  39.04 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  45.7 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  34.29 
 
 
185 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  35.4 
 
 
175 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  34.68 
 
 
185 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  35.26 
 
 
178 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  33.53 
 
 
185 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  36.02 
 
 
178 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  35.9 
 
 
177 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  38.06 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.87 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  30.86 
 
 
177 aa  92.8  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  33.71 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  41.74 
 
 
419 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  32.24 
 
 
177 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  39.06 
 
 
437 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  41.9 
 
 
439 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  38.35 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  36.69 
 
 
264 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  38.35 
 
 
455 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  31.71 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.21 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  37.9 
 
 
427 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.26 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  33.73 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  39.67 
 
 
452 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  36.94 
 
 
461 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  30.59 
 
 
438 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  40 
 
 
459 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  36.13 
 
 
435 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  31.77 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  40.95 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  39.5 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  36.13 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  39.02 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  30.99 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  38.26 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  32.9 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  36.43 
 
 
270 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  38.66 
 
 
816 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  34.68 
 
 
277 aa  71.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  37.27 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  34.43 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  34.88 
 
 
495 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  44.23 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  35.59 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  35.59 
 
 
415 aa  69.3  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  29.76 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  31.67 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  34.36 
 
 
441 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  27.75 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  30.81 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  29.03 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  42.11 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  42.11 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  33.65 
 
 
307 aa  68.2  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  33.33 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.74 
 
 
473 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  33.55 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  28.5 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  34.19 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  34.19 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  27.37 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  30.51 
 
 
379 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  32.65 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  29.28 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  29.56 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
417 aa  65.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  31.84 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  37.39 
 
 
442 aa  65.1  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>