More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3036 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3036  amino acid transporter  100 
 
 		 464 aa  919    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0805799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0976  amino acid transporter  33.77 
 
 		 470 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  31.78 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11160  predicted protein  26.13 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.882711  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  24.16 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9233  predicted protein  26.73 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000123745  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  31.82 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  24.87 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  24.87 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  23.36 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  25.55 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  29.79 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  23.75 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  23.75 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  23.75 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  23.75 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  23.75 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  23.75 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  23.75 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  30.77 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  23.5 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  26.8 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  30.61 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  23.2 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  25.58 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  25.67 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  25.2 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  26.25 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  24.56 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  28.09 
 
 		 495 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  26.24 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0241  amino acid permease  28.43 
 
 		 543 aa  74.3  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  23.88 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  24.44 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.04 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  31.28 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  29.62 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.5 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  24.5 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.5 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  23.31 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  25.82 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  26.29 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.23 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  26.67 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0344  amino acid permease family protein  30 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  32.83 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 538 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3773  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 716 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1683  amino acid transporter  25 
 
 		 508 aa  67.4  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  24.33 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2328  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal  0.251139 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 463 aa  67  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  23.75 
 
 		 471 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  23.75 
 
 		 471 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1676  amino acid permease-associated region  27.86 
 
 		 469 aa  67  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047453  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  23.75 
 
 		 471 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  22.89 
 
 		 450 aa  67  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 516 aa  66.6  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  23.88 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  25.18 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  24.53 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  25.98 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  22.86 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  26.42 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>