202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9233 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9233  predicted protein  100 
 
 
353 aa  702    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000123745  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11160  predicted protein  50.82 
 
 
433 aa  333  3e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.882711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  28.29 
 
 
446 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0976  amino acid transporter  28.57 
 
 
470 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3036  amino acid transporter  26.73 
 
 
464 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0805799  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 
770 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  23.27 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  24.78 
 
 
429 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 
538 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 
452 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  25.16 
 
 
464 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  22.85 
 
 
447 aa  60.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  24.84 
 
 
464 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 
716 aa  60.1  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  29.88 
 
 
786 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 
500 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 
435 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 
441 aa  56.6  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 
437 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  25.78 
 
 
438 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  25.78 
 
 
438 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  25.78 
 
 
438 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  25.78 
 
 
438 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  25.78 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  25.78 
 
 
438 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  25.78 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  22.09 
 
 
518 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  30.99 
 
 
486 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  22.09 
 
 
525 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  25.78 
 
 
438 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 
434 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  24.1 
 
 
491 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 
441 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 
456 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  23.55 
 
 
433 aa  53.5  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  23.15 
 
 
474 aa  53.1  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 
469 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  25.8 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  25.83 
 
 
446 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 
520 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 
443 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3585  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 
764 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 
440 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  21.83 
 
 
474 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  28 
 
 
454 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 
455 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 
473 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 
641 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 
459 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  23.41 
 
 
426 aa  50.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 
456 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 
452 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  22.65 
 
 
464 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  26.14 
 
 
500 aa  49.7  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 
515 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 
477 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 
513 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1458  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
461 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 
447 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  22.46 
 
 
473 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 
725 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  24.89 
 
 
467 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  24.89 
 
 
467 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  23.15 
 
 
466 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  23.05 
 
 
472 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  22.01 
 
 
464 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.39 
 
 
489 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  22.48 
 
 
473 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  22.7 
 
 
473 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  22.46 
 
 
473 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  22.63 
 
 
473 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28.82 
 
 
495 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  22.05 
 
 
471 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  22.48 
 
 
473 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  22.46 
 
 
473 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  22.48 
 
 
473 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  22.05 
 
 
468 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  22.48 
 
 
473 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  22.48 
 
 
473 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  22.05 
 
 
471 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  22.46 
 
 
473 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  27.91 
 
 
468 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  22.46 
 
 
473 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  23.46 
 
 
475 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  27.91 
 
 
471 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 
460 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 
500 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  27.27 
 
 
471 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  24.38 
 
 
475 aa  46.6  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  23.31 
 
 
473 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  24.47 
 
 
486 aa  47  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  24.47 
 
 
486 aa  47  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  27.56 
 
 
433 aa  46.6  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 
506 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 
495 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  24.1 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  25 
 
 
467 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  26.57 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 
455 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>