More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0983 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0983  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
919 aa  1892  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00288747  unclonable  1.95095e-05 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  26.48 
 
 
264 aa  87.8  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.28 
 
 
268 aa  85.5  4e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.40796e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  27.14 
 
 
479 aa  83.2  2e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  24.88 
 
 
278 aa  80.9  1e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  26.97 
 
 
479 aa  79  4e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  26.34 
 
 
268 aa  77.8  8e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  26.94 
 
 
269 aa  77.8  9e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  28.46 
 
 
432 aa  77  1e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  27.62 
 
 
424 aa  77  1e-12  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  31.74 
 
 
288 aa  77.8  1e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  4.10475e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  27.98 
 
 
269 aa  76.3  2e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.65758e-06  hitchhiker  2.97579e-07 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  25.43 
 
 
427 aa  76.6  2e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  27.98 
 
 
269 aa  76.3  2e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  26.85 
 
 
269 aa  76.6  2e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  27.98 
 
 
269 aa  75.9  3e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.46898e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 
476 aa  75.5  5e-12  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  26.96 
 
 
493 aa  74.7  6e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  27.46 
 
 
269 aa  74.7  8e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.56254e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  27.23 
 
 
278 aa  74.3  9e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  25.46 
 
 
269 aa  73.9  1e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  26.24 
 
 
392 aa  73.9  1e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  25.46 
 
 
269 aa  73.6  1e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  23.56 
 
 
479 aa  74.3  1e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  26.11 
 
 
475 aa  73.2  2e-11  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  26.22 
 
 
262 aa  73.6  2e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  28.77 
 
 
285 aa  73.2  2e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  25.46 
 
 
269 aa  73.2  2e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  25.45 
 
 
265 aa  73.2  2e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  25.7 
 
 
272 aa  71.6  7e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.66595e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  28.5 
 
 
351 aa  71.2  8e-11  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  26.38 
 
 
423 aa  71.2  9e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  27.11 
 
 
487 aa  70.5  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  23.35 
 
 
270 aa  70.9  1e-10  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  27.11 
 
 
487 aa  70.5  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  27.11 
 
 
487 aa  70.5  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  30.9 
 
 
513 aa  70.9  1e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  27.11 
 
 
487 aa  70.5  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  31.9 
 
 
471 aa  70.9  1e-10  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  27.11 
 
 
487 aa  70.5  1e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  28.98 
 
 
272 aa  70.9  1e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  27.19 
 
 
282 aa  70.1  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  25.19 
 
 
280 aa  69.7  2e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  31.21 
 
 
513 aa  69.7  2e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  25 
 
 
478 aa  70.1  2e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  26.42 
 
 
268 aa  69.7  2e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  3.10302e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  26.34 
 
 
487 aa  70.1  2e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.25556e-05  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  33.55 
 
 
292 aa  70.1  2e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  25.1 
 
 
268 aa  70.1  2e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  29.95 
 
 
280 aa  70.1  2e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  26.21 
 
 
279 aa  69.3  3e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  28.74 
 
 
286 aa  69.3  3e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  34.02 
 
 
307 aa  69.3  3e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  26.21 
 
 
279 aa  69.3  3e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  27.03 
 
 
484 aa  69.7  3e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  26.53 
 
 
494 aa  69.3  3e-10  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.73921e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  26.53 
 
 
494 aa  69.3  4e-10  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  26.53 
 
 
524 aa  68.9  4e-10  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  26.48 
 
 
487 aa  68.9  4e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  28.95 
 
 
482 aa  68.9  4e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  27.37 
 
 
266 aa  68.6  5e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  27.51 
 
 
275 aa  68.6  5e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  26.87 
 
 
529 aa  68.6  6e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  26.87 
 
 
487 aa  68.2  6e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  25.7 
 
 
284 aa  68.2  6e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  26.58 
 
 
488 aa  68.2  6e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  28.19 
 
 
487 aa  68.2  7e-10  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  26.2 
 
 
487 aa  67.8  8e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  26.24 
 
 
480 aa  67.8  8e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  26.2 
 
 
487 aa  68.2  8e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  26.2 
 
 
487 aa  68.2  8e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  26.2 
 
 
487 aa  68.2  8e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  26.2 
 
 
487 aa  68.2  8e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  26.2 
 
 
487 aa  68.2  8e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  26.2 
 
 
487 aa  68.2  8e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  32.31 
 
 
513 aa  68.2  8e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  26.2 
 
 
487 aa  68.2  8e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  34.09 
 
 
504 aa  67.8  9e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  25.55 
 
 
487 aa  67.8  1e-09  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  28.38 
 
 
513 aa  67.8  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  25.93 
 
 
494 aa  67.4  1e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  26.51 
 
 
566 aa  67  1e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  27.22 
 
 
277 aa  67.4  1e-09  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  28.41 
 
 
282 aa  67.4  1e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  22.8 
 
 
293 aa  67.4  1e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  28.44 
 
 
489 aa  67.4  1e-09  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  28.73 
 
 
489 aa  67.4  1e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  30.71 
 
 
480 aa  67.8  1e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  26.46 
 
 
273 aa  66.2  2e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 
503 aa  66.6  2e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  28.08 
 
 
271 aa  66.2  2e-09  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  26.38 
 
 
284 aa  66.6  2e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  26.98 
 
 
273 aa  66.2  2e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  24.12 
 
 
288 aa  67  2e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  28.37 
 
 
365 aa  66.6  2e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  28.22 
 
 
273 aa  66.6  2e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  26.11 
 
 
487 aa  66.6  2e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  28.73 
 
 
489 aa  67  2e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  24.29 
 
 
554 aa  66.6  2e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  26.64 
 
 
553 aa  66.2  2e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>