More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0870 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 328 aa  654    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  54.15 
 
 		 348 aa  342  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  50.46 
 
 		 340 aa  315  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  50.93 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  52.63 
 
 		 338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  49.39 
 
 		 346 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  52.15 
 
 		 351 aa  302  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  51.08 
 
 		 372 aa  299  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  51.06 
 
 		 346 aa  298  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  49.7 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  48.3 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  47.85 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  49.17 
 
 		 359 aa  278  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  48.17 
 
 		 333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  44.92 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  46.06 
 
 		 346 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  45.18 
 
 		 359 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  43.73 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  44.11 
 
 		 362 aa  249  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  46.34 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  43.49 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  42.9 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  44.44 
 
 		 342 aa  232  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  42.77 
 
 		 346 aa  232  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  43.69 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  41.56 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  42.46 
 
 		 348 aa  229  6e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  41.46 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  37.5 
 
 		 358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  37.2 
 
 		 358 aa  222  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  38.58 
 
 		 358 aa  222  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  38.58 
 
 		 357 aa  219  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  39.57 
 
 		 355 aa  212  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  37.65 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  37.2 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  41.59 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2911  transcriptional regulator, LacI family  39.26 
 
 		 342 aa  195  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  33.95 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  33.95 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  33.95 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  36.42 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  38.41 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  37.58 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2480  transcriptional regulator, LacI family  41.33 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.725797  normal  0.877473 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  36.06 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  33.13 
 
 		 360 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  32.82 
 
 		 363 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  32.82 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  32.82 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  32.82 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2830  transcriptional regulator, LacI family  38.23 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  32.82 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  39.46 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  32.82 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  32.82 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  32.82 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  36.44 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  32.51 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  33.64 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  34.35 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 333 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1283  lac repressor  32.72 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  34.35 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  33.33 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  34.24 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  39.53 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  38.07 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  38.86 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 355 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  37.27 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.44 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.21 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.09 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  37.09 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.56 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  38.25 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.67 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.15 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.83 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.12 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  35.17 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  37.65 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>