More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1403 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1403  ABC transporter related protein  100 
 
 
351 aa  710    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.579406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 
353 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  45.35 
 
 
353 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  47.16 
 
 
353 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  46.02 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2784  ABC-type transporter, ATPase component  41.48 
 
 
383 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  42 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  42.57 
 
 
351 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  42 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1819  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.06 
 
 
353 aa  268  8e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147813  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  40.11 
 
 
355 aa  259  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  41.53 
 
 
361 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  38.81 
 
 
355 aa  242  7e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  40.34 
 
 
349 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  35.41 
 
 
345 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.47 
 
 
353 aa  225  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0642  ABC transporter related protein  40.64 
 
 
342 aa  222  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.26 
 
 
359 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  37.95 
 
 
356 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  37.94 
 
 
357 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  33.73 
 
 
359 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.9 
 
 
353 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  44 
 
 
335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.65 
 
 
356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.63 
 
 
355 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.58 
 
 
364 aa  215  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  35.49 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794001  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  40.96 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5875  ABC transporter related protein  39.52 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0109503  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2987  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.81 
 
 
366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238574  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  34.44 
 
 
359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.73 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  34.27 
 
 
356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  33.99 
 
 
356 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 
355 aa  212  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  41.29 
 
 
355 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  41.29 
 
 
355 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.44 
 
 
380 aa  212  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  39.93 
 
 
360 aa  212  9e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.35 
 
 
367 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  43.17 
 
 
358 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  34.17 
 
 
363 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  36.36 
 
 
369 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.46 
 
 
374 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1447  ABC transporter related  43.95 
 
 
367 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.12 
 
 
357 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.04 
 
 
355 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.91 
 
 
354 aa  210  3e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.82 
 
 
370 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  38.36 
 
 
353 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6279  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  36.39 
 
 
374 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4665  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.87 
 
 
380 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.879572  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  36.36 
 
 
369 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4448  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.83 
 
 
370 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.14 
 
 
365 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3918  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.83 
 
 
370 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3609  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.83 
 
 
370 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00717179  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.16 
 
 
364 aa  209  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  36.36 
 
 
369 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1266  ABC transporter related  33.04 
 
 
365 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358849  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2547  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.15 
 
 
364 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3104  ABC transporter ATP-binding protein  40.58 
 
 
361 aa  209  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  36.36 
 
 
369 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  36.36 
 
 
369 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  35.13 
 
 
366 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1935  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.8 
 
 
357 aa  209  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.28 
 
 
374 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1216  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding subunit  40.58 
 
 
361 aa  209  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.58 
 
 
361 aa  208  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.94 
 
 
384 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2235  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 
364 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 
374 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.22 
 
 
384 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.65 
 
 
447 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3449  ABC transporter related  34.92 
 
 
363 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0527  ABC transporter related  32.85 
 
 
348 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  35.61 
 
 
370 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.66 
 
 
395 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6092  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (polyamine)  35.2 
 
 
358 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  36.04 
 
 
356 aa  206  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  36.56 
 
 
360 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  36.12 
 
 
370 aa  207  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.83 
 
 
370 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  37.33 
 
 
386 aa  206  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1525  ABC transporter related  44.73 
 
 
367 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.571493  hitchhiker  0.00153278 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003668  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  35.1 
 
 
373 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2487  ABC transporter related  39.86 
 
 
379 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00872773  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1719  ABC transporter related  37.89 
 
 
364 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2048  ABC transporter component  36.09 
 
 
363 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0666  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.87 
 
 
367 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0172946 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5428  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.97 
 
 
368 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.48813  normal  0.102518 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  37.32 
 
 
353 aa  206  6e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  37.1 
 
 
364 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  34.64 
 
 
405 aa  206  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.55 
 
 
387 aa  206  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.79 
 
 
370 aa  206  7e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.47 
 
 
368 aa  206  7e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 
355 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 
369 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>