More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4046 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  71.17 
 
 
462 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  79.52 
 
 
454 aa  741    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  79.52 
 
 
454 aa  741    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  100 
 
 
453 aa  916    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  66.74 
 
 
464 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  60.04 
 
 
465 aa  547  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  58.93 
 
 
457 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  56.86 
 
 
446 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  57.01 
 
 
465 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  52.78 
 
 
460 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  48.97 
 
 
464 aa  392  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  44.71 
 
 
448 aa  302  9e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  40.99 
 
 
464 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  41.98 
 
 
457 aa  277  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  39.09 
 
 
464 aa  273  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  40.06 
 
 
491 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  39.61 
 
 
441 aa  260  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  37.7 
 
 
438 aa  250  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  36.47 
 
 
475 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  36.47 
 
 
474 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  36.18 
 
 
503 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  33.95 
 
 
475 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  34.7 
 
 
470 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  35.29 
 
 
473 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  36.89 
 
 
468 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  35 
 
 
475 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  35 
 
 
473 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  36.47 
 
 
472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  36.6 
 
 
447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  37.8 
 
 
480 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  37.06 
 
 
470 aa  210  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  35.22 
 
 
498 aa  209  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  41.6 
 
 
490 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  37.26 
 
 
462 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  35.78 
 
 
491 aa  207  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40.86 
 
 
517 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  35.24 
 
 
490 aa  206  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  41.52 
 
 
441 aa  206  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  32.88 
 
 
477 aa  206  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  37.2 
 
 
475 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  36.86 
 
 
475 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.91 
 
 
477 aa  203  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.46 
 
 
441 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  36.18 
 
 
472 aa  202  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  32.76 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  37.43 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  32.88 
 
 
439 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  37.77 
 
 
465 aa  199  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  36.21 
 
 
470 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  31.35 
 
 
429 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  40.56 
 
 
472 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  35.27 
 
 
491 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  33.18 
 
 
471 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  33.18 
 
 
471 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  35.15 
 
 
512 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  34.93 
 
 
468 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  34.93 
 
 
468 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  34.93 
 
 
468 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  31.06 
 
 
441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  35.27 
 
 
468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  34.25 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  32 
 
 
459 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  34.25 
 
 
466 aa  189  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  38.97 
 
 
429 aa  189  8e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  34.25 
 
 
482 aa  189  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  33.25 
 
 
460 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  39.85 
 
 
513 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  38.95 
 
 
439 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  35.94 
 
 
430 aa  186  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  41.28 
 
 
523 aa  186  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  40.46 
 
 
435 aa  186  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  33.9 
 
 
468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  32.71 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  29.86 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  31.17 
 
 
741 aa  183  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  35.76 
 
 
429 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  35.25 
 
 
569 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  38.94 
 
 
503 aa  177  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  36.3 
 
 
437 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  35.74 
 
 
440 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  35.74 
 
 
440 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  34.15 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  38.43 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  29.97 
 
 
436 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  33.8 
 
 
423 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  38.93 
 
 
499 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  35.76 
 
 
412 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  34 
 
 
434 aa  167  5e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  38.26 
 
 
454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  39.33 
 
 
457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  36.67 
 
 
421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  36.67 
 
 
400 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  37.41 
 
 
512 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  36 
 
 
420 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  37.41 
 
 
472 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  36.67 
 
 
421 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  38.49 
 
 
457 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  39.08 
 
 
345 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  38.49 
 
 
457 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  37.41 
 
 
509 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>