More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0642 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0658  hypothetical protein  96.21 
 
 		 317 aa  635    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0642  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  655    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2229  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 349 aa  315  7e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.188508  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1276  lysyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 323 aa  310  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3277  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  50.77 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4614  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 325 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4705  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 325 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4622  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4762  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.827317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4741  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3935  lysyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 325 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2787  lysyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.638173  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04027  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 325 aa  298  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3835  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  49.69 
 
 		 325 aa  298  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5673  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 325 aa  298  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.17046 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4687  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 325 aa  298  6e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03989  hypothetical protein  49.69 
 
 		 325 aa  298  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4399  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 325 aa  298  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4714  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 325 aa  298  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4626  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 325 aa  298  6e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0839984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0442  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  47.52 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3855  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002238  lysyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 323 aa  295  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00130  lysyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 323 aa  295  6e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3757  lysyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0712  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 325 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.292044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3812  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 325 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3665  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 325 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0383  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0472  lysyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 325 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0420  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0344  lysyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000187091 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0046  hypothetical protein  44.75 
 
 		 343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2016  lysyl-tRNA synthetase homolog GenX  44.75 
 
 		 321 aa  288  6e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2625  lysyl-tRNA synthetase-related protein  45.9 
 
 		 356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03677  lysyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2781  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  46.34 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0913  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  45.2 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4763  hypothetical protein  40.31 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1233  tRNA synthetase class II (D K and N)  45.48 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.685644  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0588  lysyl-tRNA synthetase-like GenX  47.22 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00871089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2530  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  45.85 
 
 		 324 aa  249  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115251  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0685  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  46.39 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.572683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1319  hypothetical protein  42.9 
 
 		 329 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2207  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  40 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1083  serine/threonine protein kinase  40.8 
 
 		 325 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712957  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2581  Lysine--tRNA ligase  39.81 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2045  tRNA synthetase class II (D K and N)  41.64 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00737  tRNA synthetases class II (D, K and N) subfamily  41.12 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1740  lysine--tRNA ligase  38.58 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2126  lysine--tRNA ligase  41.01 
 
 		 316 aa  215  9e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.840396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1978  lysine--tRNA ligase  41.9 
 
 		 316 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0273  putative lysyl-tRNA synthetase, class II  39.16 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0466  Lysine--tRNA ligase  43 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.828924 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0299  lysine--tRNA ligase  39.39 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0949  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  40.88 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000776878  decreased coverage  0.000118121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0597  Lysine--tRNA ligase  35.88 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0744336  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1498  tRNA synthetase class II (D K and N)  38.51 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205908  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0076  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  36.11 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2375  lysine--tRNA ligase  35.14 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 508 aa  168  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0869  lysyl-tRNA synthetase-related protein  33.96 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.584702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 514 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2148  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  35.87 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000938384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1839  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  34.55 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000593972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3867  tRNA synthetase class II (D K and N)  34.16 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3783  tRNA synthetase class II (D K and N)  33.85 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1753  lysyl-tRNA synthetase-related protein  35.58 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1914  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.6 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000371414  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4170  tRNA synthetase class II (D K and N)  36.6 
 
 		 416 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 515 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3854  tRNA synthetase class II (D K and N)  34.29 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_772  lysyl-tRNA synthetase, truncated  31.76 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2162  tRNA synthetase class II (D K and N)  33.33 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2054  tRNA synthetase class II (D K and N)  34.62 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1764  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  35.53 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.076019  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0787  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  31.76 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2490  hypothetical protein  34.59 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3164  tRNA synthetase class II (D K and N)  32.9 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0465087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3726  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  33.44 
 
 		 340 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2955  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  34.66 
 
 		 351 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 		 523 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4013  putative lysyl-tRNA synthetase (lysine--tRNA ligase)  34.46 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1078  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  34.78 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 511 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 505 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2808  lysine--tRNA ligase  34.21 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2505  lysine--tRNA ligase  32.64 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.418111  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2793  tRNA synthetase class II (D K and N)  33.74 
 
 		 351 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 513 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 513 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 		 499 aa  145  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1642  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  33.33 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.576369  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3229  tRNA synthetase class II (D K and N)  32.93 
 
 		 352 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 573 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3004  tRNA synthetase class II (D K and N)  32.93 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0405088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 		 573 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3193  tRNA synthetase class II (D K and N)  33.23 
 
 		 352 aa  142  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 583 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0454  Lysine--tRNA ligase  32.2 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.444787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>