More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2126 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2045  tRNA synthetase class II (D K and N)  98.73 
 
 		 316 aa  637    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2126  lysine--tRNA ligase  100 
 
 		 316 aa  645    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.840396  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00737  tRNA synthetases class II (D, K and N) subfamily  74.28 
 
 		 320 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2581  Lysine--tRNA ligase  67.62 
 
 		 318 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1233  tRNA synthetase class II (D K and N)  50.17 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.685644  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4705  lysyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 325 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4614  lysyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 325 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4762  lysyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.827317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4622  lysyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4741  lysyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3855  lysyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 325 aa  265  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04027  lysyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3835  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  46.96 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3935  lysyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4399  lysyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4714  lysyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4687  lysyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03989  hypothetical protein  46.96 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4626  lysyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0839984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5673  lysyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.17046 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3277  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  44.41 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0344  lysyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000187091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0420  lysyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643447 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3757  lysyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 325 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0472  lysyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3665  lysyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 325 aa  255  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3812  lysyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 325 aa  255  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0712  lysyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 325 aa  255  8e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.292044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0685  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  49.32 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.572683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0383  lysyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2625  lysyl-tRNA synthetase-related protein  47.81 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0442  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  44.2 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002238  lysyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0466  Lysine--tRNA ligase  48.1 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.828924 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2787  lysyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 328 aa  245  8e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.638173  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03677  lysyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547578  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2229  lysyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.188508  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1276  lysyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00130  lysyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2781  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  45.19 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2207  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  42.04 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2530  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  46.18 
 
 		 324 aa  222  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115251  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2375  lysine--tRNA ligase  42.99 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0046  hypothetical protein  41.4 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2016  lysyl-tRNA synthetase homolog GenX  41.4 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4763  hypothetical protein  39.55 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1319  hypothetical protein  42.9 
 
 		 329 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0642  hypothetical protein  41.01 
 
 		 317 aa  215  9e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0658  hypothetical protein  41.01 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0913  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  42.09 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0273  putative lysyl-tRNA synthetase, class II  39.94 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3854  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.22 
 
 		 390 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0299  lysine--tRNA ligase  40.37 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1839  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  41.5 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000593972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1083  serine/threonine protein kinase  39.18 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712957  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3726  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  38.99 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3867  tRNA synthetase class II (D K and N)  38.99 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0949  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  39.74 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000776878  decreased coverage  0.000118121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3783  tRNA synthetase class II (D K and N)  38.99 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2148  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  39.35 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000938384  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1978  lysine--tRNA ligase  42.81 
 
 		 316 aa  192  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1764  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  38.83 
 
 		 301 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.076019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2162  tRNA synthetase class II (D K and N)  40.66 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0588  lysyl-tRNA synthetase-like GenX  38.51 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00871089  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2808  lysine--tRNA ligase  36.34 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1740  lysine--tRNA ligase  35.94 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2054  tRNA synthetase class II (D K and N)  40 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1914  tRNA synthetase class II (D K and N)  37.58 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000371414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0076  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  37.19 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4013  putative lysyl-tRNA synthetase (lysine--tRNA ligase)  35.45 
 
 		 351 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0869  lysyl-tRNA synthetase-related protein  34.41 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.584702  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1753  lysyl-tRNA synthetase-related protein  39.03 
 
 		 307 aa  175  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2490  hypothetical protein  37.82 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3164  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.78 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3798  Lysine--tRNA ligase  36.06 
 
 		 353 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00227981  normal  0.497071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2505  lysine--tRNA ligase  36.31 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.418111  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1498  tRNA synthetase class II (D K and N)  39.74 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205908  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0787  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  34.73 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1078  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  35.37 
 
 		 358 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_772  lysyl-tRNA synthetase, truncated  34.08 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2955  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  36.2 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2793  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.19 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1642  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  35.58 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.576369  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4127  Lysine--tRNA ligase  33.94 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271818 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6025  lysyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.858577  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2301  lysine--tRNA ligase  32.93 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275563  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2403  lysine--tRNA ligase  36.31 
 
 		 380 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.550576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0762  lysine--tRNA ligase  33.43 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2530  lysine--tRNA ligase  35.58 
 
 		 363 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.83  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3193  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.08 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0597  Lysine--tRNA ligase  34.12 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0744336  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3004  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.45 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0405088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1885  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.89 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2739  lysine--tRNA ligase  33.23 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 499 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0378  lysine--tRNA ligase  35.98 
 
 		 350 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.682721 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 489 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3477  lysine--tRNA ligase  34.65 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3224  lysine--tRNA ligase  33.75 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.428603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1654  lysine--tRNA ligase  33.84 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.693299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>