More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0685 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0685  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  100 
 
 		 314 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.572683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2229  lysyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 349 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.188508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1233  tRNA synthetase class II (D K and N)  55.74 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.685644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0442  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  48.28 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2625  lysyl-tRNA synthetase-related protein  50.78 
 
 		 356 aa  291  8e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002238  lysyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 323 aa  288  6e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00130  lysyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 323 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2787  lysyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 328 aa  285  8e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.638173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3277  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  45.79 
 
 		 326 aa  285  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03677  lysyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547578  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1978  lysine--tRNA ligase  57.62 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0472  lysyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4762  lysyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.827317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4622  lysyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4741  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4614  lysyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4705  lysyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0383  lysyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04027  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3835  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  46.39 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4399  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03989  hypothetical protein  46.39 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3855  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133285 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5673  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.17046 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4626  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0839984 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4714  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4687  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1276  lysyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 323 aa  272  5.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3935  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3757  lysyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2016  lysyl-tRNA synthetase homolog GenX  43.35 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0046  hypothetical protein  43.35 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0420  lysyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643447 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1319  hypothetical protein  47.68 
 
 		 329 aa  269  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2781  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  49.07 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0712  lysyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 325 aa  267  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.292044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3812  lysyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 325 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3665  lysyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 325 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0658  hypothetical protein  46.71 
 
 		 317 aa  266  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2045  tRNA synthetase class II (D K and N)  49.68 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0344  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000187091 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0642  hypothetical protein  46.39 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2126  lysine--tRNA ligase  49.03 
 
 		 316 aa  261  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.840396  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2581  Lysine--tRNA ligase  48.09 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00737  tRNA synthetases class II (D, K and N) subfamily  48.89 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0913  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  45.14 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0466  Lysine--tRNA ligase  49.07 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.828924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2530  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  48.3 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4763  hypothetical protein  40.56 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0588  lysyl-tRNA synthetase-like GenX  45.62 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00871089  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2207  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  42.36 
 
 		 330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0949  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  43.49 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000776878  decreased coverage  0.000118121 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1740  lysine--tRNA ligase  41.32 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1083  serine/threonine protein kinase  41.93 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712957  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0076  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  44.79 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211286 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1642  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  41.14 
 
 		 347 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.576369  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1839  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  43.6 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000593972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0273  putative lysyl-tRNA synthetase, class II  40.49 
 
 		 342 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0299  lysine--tRNA ligase  39.21 
 
 		 340 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2490  hypothetical protein  45.69 
 
 		 304 aa  212  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2162  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.95 
 
 		 305 aa  211  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2054  tRNA synthetase class II (D K and N)  44.74 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4013  putative lysyl-tRNA synthetase (lysine--tRNA ligase)  41.64 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2375  lysine--tRNA ligase  43.69 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2301  lysine--tRNA ligase  40.77 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0597  Lysine--tRNA ligase  39.14 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0744336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3229  tRNA synthetase class II (D K and N)  43.53 
 
 		 352 aa  202  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3004  tRNA synthetase class II (D K and N)  43.23 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0405088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2793  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.12 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2955  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  40.92 
 
 		 351 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2148  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  40.82 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000938384  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2739  lysine--tRNA ligase  42.01 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3224  lysine--tRNA ligase  40.75 
 
 		 361 aa  199  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.428603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1753  lysyl-tRNA synthetase-related protein  40.24 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3798  Lysine--tRNA ligase  41.41 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00227981  normal  0.497071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3193  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.35 
 
 		 352 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2808  lysine--tRNA ligase  39.7 
 
 		 350 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1498  tRNA synthetase class II (D K and N)  43.22 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205908  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4127  Lysine--tRNA ligase  39.88 
 
 		 353 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2505  lysine--tRNA ligase  40.12 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.418111  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1078  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  39.13 
 
 		 358 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0378  lysine--tRNA ligase  43.56 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.682721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1914  tRNA synthetase class II (D K and N)  40.78 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000371414  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0454  Lysine--tRNA ligase  39.81 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.444787 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0787  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  35.74 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0762  lysine--tRNA ligase  40.53 
 
 		 349 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3854  tRNA synthetase class II (D K and N)  41.96 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6025  lysyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 357 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.858577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2403  lysine--tRNA ligase  43.35 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.550576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1885  tRNA synthetase class II (D K and N)  41.23 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70209  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0869  lysyl-tRNA synthetase-related protein  37.5 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.584702  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0478  putative lysyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3867  tRNA synthetase class II (D K and N)  39.94 
 
 		 339 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2130  lysine--tRNA ligase  42.32 
 
 		 375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3783  tRNA synthetase class II (D K and N)  40.13 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_772  lysyl-tRNA synthetase, truncated  36.14 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3726  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  39.81 
 
 		 340 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3477  lysine--tRNA ligase  40.84 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1654  lysine--tRNA ligase  40.76 
 
 		 348 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.693299 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3164  tRNA synthetase class II (D K and N)  39.41 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0465087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>