170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2862 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2862  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
191 aa  394  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1905  ThiJ/PfpI domain protein  32.35 
 
 
521 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1929  ThiJ/PfpI domain protein  32.35 
 
 
527 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0357  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.03 
 
 
500 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5019  ThiJ/PfpI  30.89 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.729163  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  29.44 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  29.88 
 
 
170 aa  77.8  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  27.78 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  29.12 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  27.22 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  30.22 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  29.76 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  27.47 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  27.78 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  28.57 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  28.42 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  28.42 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  28.42 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  27.47 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  26.11 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  28.02 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  26.09 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  28.02 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  26.34 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  26.09 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  25.79 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  26.67 
 
 
186 aa  62.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  25.99 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  28.26 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  31.93 
 
 
172 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  31.93 
 
 
172 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  31.93 
 
 
172 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  31.93 
 
 
172 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  31.93 
 
 
172 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  27.27 
 
 
366 aa  61.6  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  29.24 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  29.51 
 
 
168 aa  62  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  27.07 
 
 
183 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  30.05 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  27.87 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  27.57 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  26.78 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  26.85 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  26.78 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2922  ThiJ/PfpI domain protein  28.74 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0699606  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  28.26 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  26.23 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  28.04 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  27.32 
 
 
183 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  24.19 
 
 
189 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  31.36 
 
 
172 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  31.36 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  31.36 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  31.36 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  25.26 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  27.71 
 
 
169 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  25.82 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  31.36 
 
 
172 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  31.36 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  29.19 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  31.93 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  31.36 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  31.36 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  31.36 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  29.27 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  26.67 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2828  peptidase C56, PfpI  27.27 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  27.71 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  25 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  25.56 
 
 
166 aa  57  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  27.98 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  25.65 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  26.37 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  25.68 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  27.98 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  26.46 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  27.51 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  24.46 
 
 
173 aa  55.5  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  26.78 
 
 
227 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  26.84 
 
 
204 aa  54.7  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  29.41 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  25.97 
 
 
364 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  27.17 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2318  ThiJ/PfpI domain protein  28.57 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  26.32 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  26.11 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  26.11 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  28.48 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  24.19 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  26.79 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  26.56 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1869  PfpI family intracellular peptidase  31.43 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  27.49 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  25.93 
 
 
179 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  27.27 
 
 
171 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  25 
 
 
187 aa  52  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  27.27 
 
 
171 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  26.47 
 
 
191 aa  51.6  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  24.16 
 
 
174 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  23.16 
 
 
188 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>