139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5019 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_5019  ThiJ/PfpI  100 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.729163  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0357  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.03 
 
 
500 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1929  ThiJ/PfpI domain protein  31 
 
 
527 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1905  ThiJ/PfpI domain protein  31 
 
 
521 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2862  ThiJ/PfpI domain protein  30.89 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  27.72 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  29.17 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2922  ThiJ/PfpI domain protein  28.49 
 
 
167 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0699606  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  30.88 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  26.7 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  27.93 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  27.27 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  24.86 
 
 
168 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  28.25 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  28.25 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  28.25 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  28.25 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  28.25 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  28.79 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  23.04 
 
 
189 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  25.13 
 
 
171 aa  62  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  25.13 
 
 
171 aa  62  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  28.27 
 
 
168 aa  62.4  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  28.25 
 
 
172 aa  62  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  28.25 
 
 
172 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  28.25 
 
 
172 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  28.25 
 
 
172 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  28.25 
 
 
172 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  28.25 
 
 
172 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  28.25 
 
 
172 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  24.74 
 
 
168 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  28.25 
 
 
172 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  27.96 
 
 
171 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  27.96 
 
 
171 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0077  peptidase C56, PfpI  24.87 
 
 
174 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0445898  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  27.68 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  27.68 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  25.51 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  28.72 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  26.04 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  26.04 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  26.04 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  27.23 
 
 
171 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  28.78 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  27.66 
 
 
171 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  25.13 
 
 
186 aa  58.2  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  26.18 
 
 
192 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  27.42 
 
 
171 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  27.42 
 
 
171 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  23.71 
 
 
227 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  29.41 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  25.65 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  26.7 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  24.74 
 
 
169 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  27.41 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  24.74 
 
 
169 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  26.88 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  29.41 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  27.34 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2318  ThiJ/PfpI domain protein  24.88 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  26.88 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  23.71 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  28.36 
 
 
170 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  30.43 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  25.65 
 
 
172 aa  55.1  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  25 
 
 
245 aa  54.7  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  25.26 
 
 
168 aa  54.7  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  25.74 
 
 
169 aa  54.7  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  23.04 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  25.79 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  25 
 
 
187 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  26.4 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  24.24 
 
 
179 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  23.59 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  23.83 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  26.67 
 
 
189 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  30.15 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  22.51 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  24.62 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  33.71 
 
 
189 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  33.71 
 
 
189 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  30.61 
 
 
189 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  24.62 
 
 
187 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  25.74 
 
 
190 aa  51.6  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  31.52 
 
 
179 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  29.41 
 
 
187 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  23.79 
 
 
194 aa  51.2  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  26.74 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  26.87 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  26.28 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  30.08 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  26.52 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0549  intracellular protease, PfpI family  24.82 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  26.67 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  29.09 
 
 
364 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  25.42 
 
 
366 aa  49.7  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  29.35 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  25 
 
 
180 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  27.94 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>