107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1098 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  100 
 
 		 275 aa  566  1e-161  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  63.4 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  28.95 
 
 		 470 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 		 461 aa  95.5  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 460 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 489 aa  90.5  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  27.63 
 
 		 450 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 447 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 		 450 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  27.38 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  26.3 
 
 		 476 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 476 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.2 
 
 		 473 aa  82.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 476 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  22.76 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 453 aa  79.3  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 		 453 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  23.11 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 476 aa  76.3  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 456 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  29 
 
 		 477 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.83 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 452 aa  69.7  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  26.99 
 
 		 430 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 403 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  22.76 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  21.3 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 453 aa  55.8  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 459 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  27.72 
 
 		 473 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 407 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 468 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.48 
 
 		 395 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  23.25 
 
 		 418 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0244  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0305821  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  24.47 
 
 		 460 aa  52.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 436 aa  52.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 407 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 436 aa  52  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 470 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 436 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.04 
 
 		 396 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 455 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  21.88 
 
 		 397 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.62 
 
 		 391 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.62 
 
 		 391 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.04 
 
 		 395 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.04 
 
 		 396 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 391 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 402 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 365 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  22.06 
 
 		 435 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  21.43 
 
 		 435 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  21.07 
 
 		 435 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  24.67 
 
 		 477 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 468 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.37 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 450 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  21.1 
 
 		 411 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 396 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.08 
 
 		 394 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.54 
 
 		 398 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.08 
 
 		 394 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 463 aa  45.4  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 463 aa  45.4  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 405 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 389 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 464 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  20.76 
 
 		 411 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  20.8 
 
 		 383 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  20.76 
 
 		 411 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  23.29 
 
 		 447 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.13 
 
 		 398 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.13 
 
 		 398 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.37 
 
 		 394 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.13 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.13 
 
 		 398 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  20.83 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 412 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.73 
 
 		 398 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 380 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 800 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 		 499 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>