84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0536 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  932    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  67.8 
 
 		 495 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  54.95 
 
 		 456 aa  482  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  58.45 
 
 		 436 aa  475  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  59.62 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  51.73 
 
 		 484 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  50.6 
 
 		 411 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  48.54 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  47.27 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  48.05 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  48.39 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  45.11 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  51.15 
 
 		 502 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  52.43 
 
 		 493 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  46.51 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  46.64 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  46.64 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  49.08 
 
 		 466 aa  369  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  45.49 
 
 		 472 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  50.88 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  46.02 
 
 		 463 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  45.37 
 
 		 470 aa  363  3e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  50 
 
 		 455 aa  356  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  44.82 
 
 		 445 aa  353  5e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  47.4 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  48.56 
 
 		 447 aa  348  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  45.11 
 
 		 414 aa  346  6e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  43.98 
 
 		 508 aa  343  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  45.04 
 
 		 537 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  47.63 
 
 		 479 aa  333  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  47.45 
 
 		 502 aa  331  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  43.75 
 
 		 486 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  45.28 
 
 		 477 aa  316  7e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  41.69 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  40.73 
 
 		 535 aa  291  2e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  34.25 
 
 		 541 aa  233  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  37.57 
 
 		 592 aa  220  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  41.53 
 
 		 581 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  24.06 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  23.84 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  24.87 
 
 		 361 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  25.33 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  24.1 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  24.54 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  25.25 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  26.05 
 
 		 373 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  24.92 
 
 		 402 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  24.09 
 
 		 381 aa  97.1  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  25.49 
 
 		 367 aa  97.1  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  25.63 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  24.59 
 
 		 391 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  24.07 
 
 		 351 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  25.81 
 
 		 345 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  25.27 
 
 		 337 aa  93.2  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  23.47 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  25.91 
 
 		 356 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  25.42 
 
 		 356 aa  90.5  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  25.67 
 
 		 355 aa  90.5  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  25.93 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  28.85 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  24.31 
 
 		 351 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  27.52 
 
 		 349 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  24.61 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  22.74 
 
 		 362 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  24.76 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  27.71 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  26.98 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  27 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  24.77 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  23.89 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  23.83 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  22.54 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  22.58 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  22.58 
 
 		 373 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  24.29 
 
 		 366 aa  59.7  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  23.06 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  21.24 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  25.11 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  20.75 
 
 		 359 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1915  hypothetical protein  24.77 
 
 		 325 aa  47.4  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  20.22 
 
 		 359 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  20.22 
 
 		 359 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  22.02 
 
 		 356 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>