85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4967 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  726    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  72.55 
 
 
369 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  64.51 
 
 
353 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  62.05 
 
 
381 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  65.35 
 
 
402 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  50.54 
 
 
377 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  49.45 
 
 
373 aa  363  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  52.69 
 
 
348 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  51.82 
 
 
367 aa  344  1e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  49.59 
 
 
355 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  49.16 
 
 
356 aa  335  7e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  49.16 
 
 
356 aa  332  8e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  49.16 
 
 
351 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  46.48 
 
 
345 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  49.44 
 
 
337 aa  311  9e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  50.28 
 
 
354 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  49.43 
 
 
349 aa  306  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  43.33 
 
 
376 aa  290  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  43.49 
 
 
375 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  44.41 
 
 
359 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  44.54 
 
 
359 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  44.54 
 
 
359 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  43.63 
 
 
373 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  44.9 
 
 
385 aa  258  9e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  43.02 
 
 
353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  40.11 
 
 
363 aa  240  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  39.79 
 
 
410 aa  239  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  40.65 
 
 
367 aa  236  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  41.48 
 
 
365 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  40.83 
 
 
356 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  40.28 
 
 
363 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  39.04 
 
 
398 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  39.66 
 
 
345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  31.36 
 
 
388 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  33.89 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  38.02 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  34.45 
 
 
390 aa  205  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  34.45 
 
 
361 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  33.88 
 
 
396 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  36.25 
 
 
340 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  32.1 
 
 
370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  31.82 
 
 
317 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  30.59 
 
 
320 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  29.49 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  31.63 
 
 
315 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  30.43 
 
 
366 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  26.95 
 
 
493 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  25.41 
 
 
414 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1915  hypothetical protein  31.06 
 
 
325 aa  107  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  27.04 
 
 
484 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  23.61 
 
 
486 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  25.99 
 
 
436 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  25.07 
 
 
447 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  25.37 
 
 
452 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  26 
 
 
508 aa  99.8  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  26.74 
 
 
456 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  23.1 
 
 
455 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  27.06 
 
 
427 aa  96.7  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  27.06 
 
 
455 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  27.05 
 
 
431 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  22.27 
 
 
483 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  21.52 
 
 
502 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  23.86 
 
 
470 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  26.37 
 
 
502 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  23.75 
 
 
445 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  23.82 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  24.39 
 
 
463 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  25.17 
 
 
466 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  24.43 
 
 
480 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  23.19 
 
 
465 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  24.09 
 
 
463 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  24.09 
 
 
463 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  22.32 
 
 
477 aa  86.3  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  24.61 
 
 
537 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  23.56 
 
 
495 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  23 
 
 
472 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  22.74 
 
 
467 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  25.07 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  21.47 
 
 
462 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  21.59 
 
 
506 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  23.66 
 
 
479 aa  76.3  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  23.51 
 
 
592 aa  70.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  21.36 
 
 
541 aa  70.1  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  18.78 
 
 
535 aa  63.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  21.51 
 
 
581 aa  60.1  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>