85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0309 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  661    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  65.09 
 
 		 349 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  52.72 
 
 		 354 aa  325  5e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  51.87 
 
 		 353 aa  322  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  50.28 
 
 		 381 aa  315  6e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  50.86 
 
 		 402 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  49.44 
 
 		 362 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  52.89 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  48.06 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  50.14 
 
 		 369 aa  296  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  47.99 
 
 		 351 aa  295  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  47.56 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  47.25 
 
 		 377 aa  285  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  45.43 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  45.43 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  45.43 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  45.11 
 
 		 373 aa  275  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  44.69 
 
 		 376 aa  275  8e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  46.51 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  45.94 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  45.56 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  46.53 
 
 		 356 aa  268  8e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  45.16 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  46.06 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  45.4 
 
 		 356 aa  258  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  45.48 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  46.36 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  44.16 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  45.38 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  48.29 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  43.89 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  40.68 
 
 		 410 aa  216  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  39.95 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  36.39 
 
 		 370 aa  189  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  31.67 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  37.68 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  33.06 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  31.79 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  32.49 
 
 		 361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  29.94 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  31.23 
 
 		 317 aa  145  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  30.06 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  30.54 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  36.64 
 
 		 366 aa  119  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  31.64 
 
 		 315 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  31.47 
 
 		 493 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  32.02 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1915  hypothetical protein  34.52 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  31.5 
 
 		 495 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  27.62 
 
 		 483 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  29.67 
 
 		 455 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  28.03 
 
 		 502 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  30.42 
 
 		 452 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  28.57 
 
 		 508 aa  99.4  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  25.99 
 
 		 484 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  28.95 
 
 		 470 aa  95.9  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  29.24 
 
 		 431 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  25.75 
 
 		 467 aa  94  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  27.09 
 
 		 447 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  31.54 
 
 		 477 aa  93.6  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  28.76 
 
 		 411 aa  92.8  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  27.62 
 
 		 486 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  29.18 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  27.8 
 
 		 414 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  28.51 
 
 		 427 aa  89.7  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  29.72 
 
 		 480 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  27.08 
 
 		 463 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  26.35 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  26.35 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  27.34 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  26.35 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  28.17 
 
 		 502 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  26.91 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  27.09 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  27.82 
 
 		 537 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  27.16 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  24.71 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  26.05 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  29.17 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  26 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  27.13 
 
 		 581 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  28.33 
 
 		 541 aa  66.6  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  27 
 
 		 592 aa  64.3  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  21.96 
 
 		 535 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>