85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0721 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  973    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  59.41 
 
 
508 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  55.73 
 
 
477 aa  478  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  51.48 
 
 
502 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  51.63 
 
 
479 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  43.75 
 
 
483 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  44.35 
 
 
502 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  46.9 
 
 
493 aa  363  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  45.2 
 
 
436 aa  350  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  44.77 
 
 
456 aa  350  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  46.04 
 
 
495 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  45.22 
 
 
455 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  43.81 
 
 
480 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  44.13 
 
 
431 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  43.86 
 
 
467 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  41.87 
 
 
484 aa  325  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  46.98 
 
 
411 aa  323  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  45.32 
 
 
466 aa  322  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  41.94 
 
 
470 aa  319  7.999999999999999e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  44.01 
 
 
452 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  40.38 
 
 
466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  44.8 
 
 
455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  39 
 
 
535 aa  311  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  43.06 
 
 
472 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  42.92 
 
 
447 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  41.08 
 
 
465 aa  309  8e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  42.12 
 
 
462 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  41.15 
 
 
427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  41.25 
 
 
463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  41.25 
 
 
463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  42.4 
 
 
463 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  42.63 
 
 
537 aa  300  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  41.61 
 
 
445 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  39.95 
 
 
414 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  40.09 
 
 
506 aa  286  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  41.88 
 
 
592 aa  279  8e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  36.14 
 
 
541 aa  259  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  35.15 
 
 
581 aa  213  7e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  23.12 
 
 
390 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  23.37 
 
 
361 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  23.61 
 
 
362 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  21.61 
 
 
396 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  25.96 
 
 
351 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  27.27 
 
 
348 aa  97.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  26.37 
 
 
356 aa  97.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  27.5 
 
 
377 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  24.15 
 
 
353 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  26.64 
 
 
345 aa  94.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  25 
 
 
373 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  23.85 
 
 
388 aa  93.6  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  26.03 
 
 
356 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  26.09 
 
 
369 aa  91.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  27.62 
 
 
337 aa  91.3  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  25.8 
 
 
340 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  25.98 
 
 
355 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  22.87 
 
 
381 aa  87  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  24.81 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  21.99 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  24.61 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  24.69 
 
 
349 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  24.71 
 
 
354 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  24.21 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  23.99 
 
 
373 aa  79.7  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  24.48 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  23.79 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  26 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  28 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  27.72 
 
 
317 aa  72  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  28.04 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  24.88 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  24.22 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  23.79 
 
 
359 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  23.79 
 
 
359 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  23.81 
 
 
320 aa  63.9  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  23.3 
 
 
359 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  23.02 
 
 
363 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  26.28 
 
 
365 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  22.68 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  25.45 
 
 
398 aa  54.3  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  21.9 
 
 
356 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  24.26 
 
 
366 aa  50.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  23.14 
 
 
315 aa  50.4  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  21.12 
 
 
353 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  23.97 
 
 
478 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  22.08 
 
 
320 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>