84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1525 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  881    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  51.13 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  48.89 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  50.65 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  50.91 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  48.04 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  52.62 
 
 		 493 aa  365  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  51.16 
 
 		 411 aa  363  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  55.01 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  49.48 
 
 		 495 aa  362  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  46.07 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  53.31 
 
 		 431 aa  358  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  45.81 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  45.81 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  48.39 
 
 		 537 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  47.62 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  49.21 
 
 		 470 aa  348  8e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  48.04 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  45.03 
 
 		 462 aa  345  8e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  49.39 
 
 		 502 aa  344  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  47.59 
 
 		 472 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  45.02 
 
 		 465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  45.81 
 
 		 480 aa  339  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  43.89 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  44.55 
 
 		 455 aa  336  5e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  47.42 
 
 		 508 aa  334  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  43.7 
 
 		 414 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  45.35 
 
 		 452 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  44.85 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  46.53 
 
 		 477 aa  323  4e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  49.03 
 
 		 479 aa  323  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  47.34 
 
 		 445 aa  318  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  42.92 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  41.59 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  40.57 
 
 		 535 aa  280  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  36.93 
 
 		 541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  37.6 
 
 		 592 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  44.81 
 
 		 581 aa  159  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  28.61 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  28.16 
 
 		 373 aa  120  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  26.1 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  25.41 
 
 		 381 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  26.02 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  28.25 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  27.55 
 
 		 356 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  24.68 
 
 		 396 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  29.26 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  25.28 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  25.68 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  27.15 
 
 		 369 aa  104  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  25.07 
 
 		 362 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  24.52 
 
 		 361 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  23.68 
 
 		 402 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  25.95 
 
 		 348 aa  97.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  27.09 
 
 		 337 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  23.89 
 
 		 390 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  27.83 
 
 		 340 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  23.56 
 
 		 367 aa  93.2  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  23.58 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  25 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  23.39 
 
 		 351 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  23.2 
 
 		 388 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  26.79 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  25.95 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  27.96 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  26.89 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  28.23 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  23.08 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  22.45 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  28.25 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  23.66 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  23.88 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  22.89 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  22.89 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  22.89 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  23.41 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  24.3 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  27.47 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  21.73 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  25 
 
 		 320 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  24.5 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  25.46 
 
 		 353 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  20.61 
 
 		 315 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  23.01 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>