83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0940 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  76.72 
 
 		 455 aa  662    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  877    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  55.74 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  53.78 
 
 		 484 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  54.2 
 
 		 456 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  53.97 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  48.67 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  48.21 
 
 		 467 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  47.04 
 
 		 483 aa  362  6e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  47.21 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  52.83 
 
 		 431 aa  358  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  47.73 
 
 		 495 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  46.57 
 
 		 502 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  45.56 
 
 		 414 aa  349  6e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  47.02 
 
 		 466 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  52.51 
 
 		 493 aa  346  5e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  44.59 
 
 		 463 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  44.59 
 
 		 463 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  44.08 
 
 		 470 aa  341  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  45.77 
 
 		 480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  46.84 
 
 		 463 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  49.1 
 
 		 445 aa  338  8e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  41.89 
 
 		 462 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  46.19 
 
 		 472 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  49.28 
 
 		 537 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  45.53 
 
 		 508 aa  334  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  43.08 
 
 		 465 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  42.52 
 
 		 506 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  45.35 
 
 		 447 aa  330  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  47 
 
 		 502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  47.27 
 
 		 479 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  48.21 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  43.47 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  43.15 
 
 		 466 aa  297  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  41.33 
 
 		 535 aa  272  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  37.14 
 
 		 541 aa  257  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  38.96 
 
 		 592 aa  242  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  31.74 
 
 		 581 aa  182  8.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  26.63 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  27.88 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  22.14 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  29.56 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  30.71 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  30.57 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  26.43 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  24.43 
 
 		 391 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  28.22 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  25.37 
 
 		 362 aa  100  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  29.06 
 
 		 402 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  30.42 
 
 		 337 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  23.99 
 
 		 361 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  26.25 
 
 		 355 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  27.54 
 
 		 348 aa  93.6  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  26.74 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  27.27 
 
 		 354 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  26.88 
 
 		 367 aa  92.8  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  25.19 
 
 		 390 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  25.61 
 
 		 345 aa  90.9  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  25.19 
 
 		 351 aa  90.1  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  30.04 
 
 		 367 aa  87  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  26.32 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  23.31 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  19.75 
 
 		 388 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  27.27 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  28.92 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  25.48 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  25.1 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  25.81 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  29.17 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  24.41 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  28.89 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  23.4 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  24.54 
 
 		 359 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  24.54 
 
 		 359 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  24.07 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  25.12 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  24.4 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  25.39 
 
 		 366 aa  54.3  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  23.74 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  30.17 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  23.9 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  22.47 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  22.33 
 
 		 320 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>