80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11450 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  100 
 
 
541 aa  1055    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  39.41 
 
 
502 aa  311  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  40.55 
 
 
483 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  39.88 
 
 
502 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  43.12 
 
 
479 aa  273  7e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  41.04 
 
 
436 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  38.34 
 
 
508 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  41.94 
 
 
493 aa  261  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  39.25 
 
 
477 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  36.14 
 
 
486 aa  259  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  37.19 
 
 
484 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  37.33 
 
 
452 aa  256  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  38.03 
 
 
466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  40.16 
 
 
456 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  38.57 
 
 
537 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  36.54 
 
 
455 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  34.61 
 
 
480 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  37.38 
 
 
427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  40.1 
 
 
431 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  37.76 
 
 
411 aa  238  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  36.93 
 
 
447 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  36.95 
 
 
470 aa  233  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  36.27 
 
 
462 aa  233  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  34.25 
 
 
467 aa  232  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  36.72 
 
 
535 aa  231  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  36.54 
 
 
445 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  35.64 
 
 
495 aa  226  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  37.06 
 
 
463 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  37.06 
 
 
463 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  37.06 
 
 
463 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  35.28 
 
 
465 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  34.36 
 
 
414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  34.93 
 
 
466 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  34.93 
 
 
472 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  33.11 
 
 
592 aa  213  7e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  34.27 
 
 
455 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  32.55 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  40.08 
 
 
581 aa  150  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  25.93 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  24.4 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  24.81 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  25.48 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  23.17 
 
 
353 aa  76.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  27.03 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  23.05 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  25.69 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  24.29 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  22.3 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  24.79 
 
 
345 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  22.19 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  21.36 
 
 
362 aa  70.1  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  21.02 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  24.17 
 
 
351 aa  67  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  28.33 
 
 
337 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  26.69 
 
 
365 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  27.69 
 
 
345 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  23.54 
 
 
354 aa  64.3  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  23.26 
 
 
351 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  20.9 
 
 
390 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  20.66 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  20.84 
 
 
375 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  23.73 
 
 
369 aa  61.2  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  25.4 
 
 
367 aa  60.1  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  25.83 
 
 
349 aa  60.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  20.32 
 
 
391 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  21.86 
 
 
348 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  23.88 
 
 
385 aa  54.3  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  26.89 
 
 
363 aa  54.3  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  24.85 
 
 
366 aa  54.3  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  21.52 
 
 
315 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  23.33 
 
 
367 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  21.94 
 
 
340 aa  51.6  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  22.44 
 
 
373 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  24.63 
 
 
320 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  23.39 
 
 
359 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  23.39 
 
 
359 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  23.39 
 
 
359 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  22.39 
 
 
370 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  23.5 
 
 
410 aa  45.8  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  22.46 
 
 
320 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>