85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1626 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  89.42 
 
 		 390 aa  660    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  724    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  55.91 
 
 		 391 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  49.72 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  44.13 
 
 		 388 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  38.03 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  36.29 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  34.04 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  36.11 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  34.45 
 
 		 362 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  32.97 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  31.82 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  32.51 
 
 		 353 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  32.93 
 
 		 376 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  34.11 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  33.14 
 
 		 373 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  33.43 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  31.61 
 
 		 375 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  30.75 
 
 		 356 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  33.52 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  31.2 
 
 		 367 aa  176  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  30.32 
 
 		 377 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  34.21 
 
 		 351 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  30.19 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  31.98 
 
 		 349 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  33.12 
 
 		 345 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  32.49 
 
 		 337 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  31.55 
 
 		 363 aa  162  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  32.58 
 
 		 345 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  33.23 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  32.08 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  32.12 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  28.72 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  28.72 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  33.9 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  28.99 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  30.73 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  29.77 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  31.68 
 
 		 320 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  30.31 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  30.16 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  27.41 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  29.14 
 
 		 356 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  30.7 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  28.57 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  28.68 
 
 		 370 aa  126  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  26.02 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  24.6 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  27.57 
 
 		 493 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  25.36 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  25.24 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  24.76 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  23.93 
 
 		 456 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  23.37 
 
 		 486 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  24.87 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  23.48 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  25.61 
 
 		 427 aa  99.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  24.52 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  24.53 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1915  hypothetical protein  27.59 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  23.99 
 
 		 452 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  22.71 
 
 		 495 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  23.94 
 
 		 431 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  24.32 
 
 		 479 aa  95.9  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  24.33 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  22.81 
 
 		 508 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  23.74 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  23.34 
 
 		 455 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  23.74 
 
 		 463 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  23.74 
 
 		 463 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  23.23 
 
 		 470 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  22.9 
 
 		 480 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  24.16 
 
 		 411 aa  90.1  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  23.6 
 
 		 445 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  21.97 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  25.08 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  21.97 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  24.28 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  21.96 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  21.6 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  22.19 
 
 		 541 aa  70.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  20.34 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  21.27 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  21.52 
 
 		 592 aa  56.2  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  21.79 
 
 		 581 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>