81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3040 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  889    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  57.93 
 
 		 462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  57.95 
 
 		 465 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  55.19 
 
 		 472 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  57.11 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  57.11 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  56.09 
 
 		 463 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  57.68 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  54.55 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  53.88 
 
 		 470 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  48.38 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  50.23 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  44.98 
 
 		 455 aa  359  7e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  48.46 
 
 		 436 aa  358  8e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  44.84 
 
 		 467 aa  356  5e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  45.86 
 
 		 495 aa  351  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  48.81 
 
 		 431 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  45.75 
 
 		 484 aa  339  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  49.1 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  46.53 
 
 		 455 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  46.99 
 
 		 502 aa  333  4e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  47.87 
 
 		 483 aa  333  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  45.39 
 
 		 414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  45.65 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  42.66 
 
 		 411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  47.34 
 
 		 447 aa  317  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  44.08 
 
 		 537 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  45.73 
 
 		 493 aa  313  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  44.82 
 
 		 502 aa  312  5.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  42.82 
 
 		 508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  44.77 
 
 		 477 aa  300  5e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  41.61 
 
 		 486 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  45.13 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  42.38 
 
 		 479 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  38.57 
 
 		 535 aa  257  4e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  36.54 
 
 		 541 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  37.5 
 
 		 592 aa  219  7.999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  46.2 
 
 		 581 aa  161  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  26.41 
 
 		 356 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  25.96 
 
 		 353 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  23.84 
 
 		 381 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  26.41 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  23.77 
 
 		 362 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  24.61 
 
 		 373 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  23.6 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  22.98 
 
 		 390 aa  87  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  24.52 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  24.71 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  21.38 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  22.43 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  25.39 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  24.14 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  26.17 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  23.34 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  24.81 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  23.57 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  22.35 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  24.51 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  21.45 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  22.07 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  27.47 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  23.14 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  22.33 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  26.29 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  21.02 
 
 		 396 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  22.59 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  21.88 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  22.55 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  22.14 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  27.68 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  20.1 
 
 		 370 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  21.88 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  53.9  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  24 
 
 		 365 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  30.17 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  30.17 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  30.17 
 
 		 359 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  22.87 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  27.68 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  23.26 
 
 		 356 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  29.91 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.442538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>