84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4112 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  843    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  93.4 
 
 
484 aa  788    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  54.22 
 
 
456 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  53.53 
 
 
414 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  47.05 
 
 
495 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  51.82 
 
 
436 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  54.1 
 
 
452 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  51.63 
 
 
455 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  52.95 
 
 
431 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  48.54 
 
 
467 aa  395  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  50 
 
 
455 aa  391  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  50.37 
 
 
480 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  50.79 
 
 
502 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  50.91 
 
 
447 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  48.17 
 
 
470 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  49.75 
 
 
483 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  54.88 
 
 
493 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  50 
 
 
411 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  47.64 
 
 
466 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  46.05 
 
 
463 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  46.05 
 
 
463 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  47.8 
 
 
465 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  48.35 
 
 
463 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  44.34 
 
 
472 aa  361  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  46.34 
 
 
462 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  48.05 
 
 
537 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  49.22 
 
 
502 aa  351  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  48.97 
 
 
479 aa  348  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  46.38 
 
 
508 aa  342  5.999999999999999e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  45.65 
 
 
445 aa  338  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  45.52 
 
 
506 aa  334  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  46.72 
 
 
477 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  47.75 
 
 
466 aa  320  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  41.15 
 
 
486 aa  317  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  40.75 
 
 
535 aa  278  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  37.38 
 
 
541 aa  253  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  38.28 
 
 
592 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  46.96 
 
 
581 aa  160  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  25.65 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  26.63 
 
 
353 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  25.32 
 
 
373 aa  106  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  27.84 
 
 
356 aa  106  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  25.61 
 
 
361 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  25.94 
 
 
381 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  27.06 
 
 
362 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  23.66 
 
 
396 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  25.39 
 
 
377 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  26.67 
 
 
356 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  26.83 
 
 
354 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  26.01 
 
 
351 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  24.86 
 
 
390 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  25.62 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  26.69 
 
 
345 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  25.72 
 
 
376 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  28.51 
 
 
337 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  28.99 
 
 
369 aa  93.6  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  25.21 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  25.14 
 
 
317 aa  90.9  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  24.52 
 
 
375 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  26.5 
 
 
348 aa  90.1  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  24.44 
 
 
355 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  28.12 
 
 
349 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  27.4 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  24.23 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  25.34 
 
 
351 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  23.71 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  26.56 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  23.86 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  24.57 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  27.71 
 
 
363 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  23.2 
 
 
367 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  24.54 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  25.91 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  23.35 
 
 
359 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  22.19 
 
 
410 aa  59.7  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  23.23 
 
 
320 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  24.18 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  23.97 
 
 
320 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  23.46 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  23.46 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  24.31 
 
 
365 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  23.2 
 
 
363 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  22.97 
 
 
370 aa  55.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  23.2 
 
 
356 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>