84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4379 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  832    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  53.66 
 
 
484 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  53.53 
 
 
427 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  49.24 
 
 
456 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  48.68 
 
 
483 aa  360  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  48.19 
 
 
470 aa  359  6e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  48.95 
 
 
502 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  46.78 
 
 
436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  45.35 
 
 
495 aa  355  6.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  47.11 
 
 
463 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  47.11 
 
 
463 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  46.84 
 
 
463 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  45.56 
 
 
452 aa  349  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  45.28 
 
 
467 aa  345  6e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  46.08 
 
 
465 aa  345  7e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  43.54 
 
 
466 aa  341  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  44.95 
 
 
472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  44.56 
 
 
462 aa  338  9e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  45.48 
 
 
455 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  47.83 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  43.7 
 
 
447 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  45.68 
 
 
480 aa  333  5e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  45.39 
 
 
445 aa  329  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  47.2 
 
 
455 aa  329  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  42.37 
 
 
508 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  43.92 
 
 
506 aa  323  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  45.67 
 
 
493 aa  321  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  46.17 
 
 
411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  43.71 
 
 
537 aa  319  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  44.02 
 
 
502 aa  315  8e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  45.62 
 
 
479 aa  311  9e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  44.01 
 
 
466 aa  296  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  42.75 
 
 
477 aa  295  9e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  39.95 
 
 
486 aa  291  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  37.63 
 
 
535 aa  239  5e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  38.5 
 
 
592 aa  228  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  34.36 
 
 
541 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  46.2 
 
 
581 aa  161  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  28.49 
 
 
356 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  26.7 
 
 
353 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  27.81 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  28.02 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  26.87 
 
 
351 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  25.41 
 
 
362 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  25.85 
 
 
377 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  25.13 
 
 
373 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  27.31 
 
 
345 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  25.34 
 
 
402 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  24.26 
 
 
381 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  23.48 
 
 
361 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  25.14 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  23.91 
 
 
388 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  21.79 
 
 
396 aa  92.8  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  23.78 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  23.42 
 
 
367 aa  92  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  27.8 
 
 
337 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  21.95 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  25.56 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  21.89 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  24.49 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  25.76 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  22.84 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  22.76 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  22.93 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  22.83 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  21.86 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  24.42 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  25.79 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  26.46 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  23.59 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  22.53 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  22.86 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  22.04 
 
 
359 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  22.04 
 
 
359 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  20.66 
 
 
363 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  22.3 
 
 
359 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  24.4 
 
 
320 aa  60.1  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  22.98 
 
 
410 aa  55.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  22.96 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  22.22 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  22.54 
 
 
366 aa  47.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  26.03 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  21.88 
 
 
356 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  22.22 
 
 
320 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>