84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3800 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  971    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  68.01 
 
 		 467 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  56.5 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  56.02 
 
 		 436 aa  471  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  60.1 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  48.2 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  46.51 
 
 		 484 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  50.6 
 
 		 411 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  49.88 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  47.75 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  47.75 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  46.06 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  48.39 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  50.38 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  46.43 
 
 		 470 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  45.55 
 
 		 472 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  47.54 
 
 		 463 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  45.18 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  44.38 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  47.54 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  46.4 
 
 		 414 aa  364  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  49.14 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  50.36 
 
 		 452 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  48.51 
 
 		 447 aa  360  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  52.23 
 
 		 493 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  45.4 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  45.87 
 
 		 445 aa  350  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  45.58 
 
 		 486 aa  346  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  44.28 
 
 		 508 aa  345  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  45.95 
 
 		 537 aa  341  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  49 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  47.51 
 
 		 502 aa  333  4e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  43.66 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  45.79 
 
 		 535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  43.66 
 
 		 466 aa  292  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  35.16 
 
 		 541 aa  230  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  35.71 
 
 		 592 aa  223  8e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  45.5 
 
 		 581 aa  167  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  31.5 
 
 		 337 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  27.76 
 
 		 354 aa  99.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  26.85 
 
 		 355 aa  97.8  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  24.8 
 
 		 381 aa  96.7  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  23.85 
 
 		 361 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  22.56 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  22.4 
 
 		 390 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  27.68 
 
 		 356 aa  94.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  23.02 
 
 		 388 aa  94.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  25.24 
 
 		 353 aa  94  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  23.4 
 
 		 391 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  24.51 
 
 		 340 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  26.94 
 
 		 356 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  24.74 
 
 		 373 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  27.24 
 
 		 377 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  23.92 
 
 		 376 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  22.6 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  24.84 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  24.8 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  23.41 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  24.41 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  24.39 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  24.58 
 
 		 367 aa  79.7  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  27.09 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  25.07 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  24.67 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  26.03 
 
 		 317 aa  76.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  24.32 
 
 		 373 aa  67  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  23.45 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  25.71 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  27.67 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  26.51 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  21.58 
 
 		 359 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  22.33 
 
 		 320 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  26.82 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  22.4 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  22.4 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  21.07 
 
 		 363 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  22.47 
 
 		 366 aa  54.3  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  25.67 
 
 		 365 aa  53.9  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  22.64 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  26.72 
 
 		 367 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  21.75 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  21.05 
 
 		 410 aa  48.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  20.33 
 
 		 353 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1915  hypothetical protein  31.5 
 
 		 325 aa  43.5  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>