77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19090 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  100 
 
 
535 aa  1052    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  43.36 
 
 
502 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  44.47 
 
 
483 aa  333  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  47.21 
 
 
411 aa  330  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  41.56 
 
 
508 aa  323  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  39.6 
 
 
486 aa  323  7e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  44.39 
 
 
493 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  40.82 
 
 
466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  44.94 
 
 
477 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  44.04 
 
 
502 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  46.01 
 
 
495 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  40.22 
 
 
436 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  40.58 
 
 
467 aa  292  9e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  40.98 
 
 
479 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  42.76 
 
 
456 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  39.15 
 
 
484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  40.82 
 
 
537 aa  283  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  40 
 
 
470 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  40.57 
 
 
447 aa  280  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  40.2 
 
 
480 aa  279  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  42.25 
 
 
455 aa  276  8e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  41.38 
 
 
431 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  38.77 
 
 
427 aa  273  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  40.84 
 
 
452 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  42.6 
 
 
455 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  38.46 
 
 
445 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  37.35 
 
 
463 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  37.35 
 
 
463 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  37.59 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  35.34 
 
 
465 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  39.57 
 
 
463 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  36.19 
 
 
472 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  37.25 
 
 
466 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  38.63 
 
 
592 aa  242  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  34.59 
 
 
541 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  37.63 
 
 
414 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  36.39 
 
 
506 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  38.59 
 
 
581 aa  139  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  22.19 
 
 
367 aa  72  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  23.55 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  24.18 
 
 
354 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  21.27 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  22.17 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  24.32 
 
 
356 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  22.28 
 
 
355 aa  65.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  19.34 
 
 
396 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  24.39 
 
 
375 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  20.69 
 
 
351 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  25.19 
 
 
348 aa  63.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  20 
 
 
390 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  22.39 
 
 
376 aa  62  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  19.06 
 
 
362 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  22.43 
 
 
381 aa  60.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  24.38 
 
 
317 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  23.11 
 
 
340 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  23.04 
 
 
385 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  22.14 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  21.93 
 
 
369 aa  57  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  23.56 
 
 
410 aa  55.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  20.36 
 
 
353 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  21.94 
 
 
373 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  20.69 
 
 
373 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  18.87 
 
 
388 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  25.36 
 
 
320 aa  51.2  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  21.84 
 
 
402 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  22.94 
 
 
398 aa  50.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  23.63 
 
 
337 aa  50.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  23.89 
 
 
367 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  23.41 
 
 
345 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  20.74 
 
 
351 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  19.14 
 
 
391 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  19.12 
 
 
349 aa  47.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  23.21 
 
 
363 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  21.7 
 
 
359 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  21.7 
 
 
359 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  21.7 
 
 
359 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  23.56 
 
 
366 aa  43.5  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.442538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>