84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3786 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  76.94 
 
 		 452 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  890    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  54.95 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  50.95 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  51.1 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  51.63 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  49.65 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  46.68 
 
 		 480 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  48.17 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  54.05 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  46.15 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  45.96 
 
 		 502 aa  363  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  50.52 
 
 		 495 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  43.1 
 
 		 463 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  43.1 
 
 		 463 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  50 
 
 		 467 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  44.76 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  42.07 
 
 		 465 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  45.52 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  45.6 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  41.8 
 
 		 472 aa  352  7e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  42.41 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  44.62 
 
 		 470 aa  347  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  51.64 
 
 		 493 aa  345  8e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  49.88 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  45.48 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  45.22 
 
 		 486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  44.55 
 
 		 447 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  48.05 
 
 		 537 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  45.66 
 
 		 508 aa  333  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  43.36 
 
 		 506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  49.87 
 
 		 502 aa  325  8.000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  47.95 
 
 		 479 aa  322  9.000000000000001e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  44.53 
 
 		 466 aa  302  9e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  42.25 
 
 		 535 aa  276  6e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  36.54 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  38.68 
 
 		 592 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  31.47 
 
 		 581 aa  184  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  26.25 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  28.87 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  29.67 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  27.92 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  28.3 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  28.21 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  29.88 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  27.74 
 
 		 356 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  27.06 
 
 		 362 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  27.76 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  26.37 
 
 		 345 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  27.59 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  28.67 
 
 		 369 aa  93.2  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  23.34 
 
 		 361 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  20.2 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  25.38 
 
 		 351 aa  90.1  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  21.91 
 
 		 391 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  23.14 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  26.27 
 
 		 348 aa  86.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  26.6 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  27.71 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  25.16 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  25.88 
 
 		 355 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  20.83 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  27.49 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  25.3 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  26.21 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  29.55 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  28.18 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  23.94 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  27.71 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  25.93 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  22.98 
 
 		 370 aa  67  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  24.07 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  24.07 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  23.61 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  27.56 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  24.81 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  23.9 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  26.15 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  23.17 
 
 		 353 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  24.63 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  21.89 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  23.71 
 
 		 320 aa  50.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  24.12 
 
 		 356 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1915  hypothetical protein  31.2 
 
 		 325 aa  44.3  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>