85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2233 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  726    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  56.28 
 
 
317 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  53.95 
 
 
320 aa  355  5e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  53.7 
 
 
320 aa  347  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  50.82 
 
 
315 aa  300  3e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  29.97 
 
 
391 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  32.08 
 
 
388 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  34.04 
 
 
349 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  30.31 
 
 
361 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  30.39 
 
 
390 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  31.48 
 
 
345 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  31.12 
 
 
396 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  30.63 
 
 
402 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  30.23 
 
 
381 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  31.12 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  37.6 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  31.12 
 
 
353 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  29.7 
 
 
375 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  32.98 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  31.59 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  29.62 
 
 
376 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  30.69 
 
 
362 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  33.1 
 
 
351 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  34.17 
 
 
377 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  30.56 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  28.34 
 
 
373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  35.37 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  30.67 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  31.22 
 
 
356 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  32.41 
 
 
370 aa  126  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  30.95 
 
 
356 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  35.15 
 
 
355 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  29.53 
 
 
359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  29.15 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  29.53 
 
 
359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  36.48 
 
 
363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  33.56 
 
 
353 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  29.27 
 
 
359 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  32.6 
 
 
385 aa  115  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  32 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  30.66 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  29.44 
 
 
363 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  31.85 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1915  hypothetical protein  34.05 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  25.38 
 
 
436 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  33.07 
 
 
398 aa  93.6  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  26.41 
 
 
456 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  28 
 
 
477 aa  87  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  25 
 
 
411 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  24.26 
 
 
537 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  25.12 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  28.43 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  24.4 
 
 
502 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  25.45 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  26.32 
 
 
479 aa  73.2  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  25 
 
 
447 aa  72.8  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  24.87 
 
 
467 aa  72.8  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  24.13 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  28.21 
 
 
493 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  26.22 
 
 
452 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  23.53 
 
 
502 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  25.58 
 
 
465 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  24.55 
 
 
427 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  27.41 
 
 
472 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  27.71 
 
 
480 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  24.81 
 
 
462 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  23.76 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  27.41 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  27.41 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  23.35 
 
 
592 aa  65.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  27.03 
 
 
463 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  25.48 
 
 
483 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  25.63 
 
 
455 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  24.39 
 
 
541 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  23.1 
 
 
495 aa  62.8  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  26.21 
 
 
470 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  23.01 
 
 
486 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  23.33 
 
 
535 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  25.49 
 
 
466 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  21.25 
 
 
414 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  26.32 
 
 
581 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  22.86 
 
 
445 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  22.15 
 
 
506 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>