57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1915 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1915  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  627  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  33 
 
 
345 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  32 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  33.67 
 
 
365 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  32.01 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  34.11 
 
 
355 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  36.8 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  32.05 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  33.9 
 
 
349 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  32.03 
 
 
317 aa  113  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  31.78 
 
 
381 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  29.57 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  32.59 
 
 
356 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  32.16 
 
 
402 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  33.09 
 
 
315 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  30.28 
 
 
376 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  31.53 
 
 
375 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  32.99 
 
 
345 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  31.06 
 
 
362 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  32.91 
 
 
356 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  34.52 
 
 
337 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  26.48 
 
 
388 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  32.03 
 
 
320 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  32.8 
 
 
369 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  34.13 
 
 
367 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  31.42 
 
 
351 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  35.17 
 
 
385 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  33.98 
 
 
373 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  34.26 
 
 
363 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  34.16 
 
 
354 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  30.82 
 
 
353 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  33.69 
 
 
320 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  31.09 
 
 
410 aa  98.6  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  31.09 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  27.04 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  31.09 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  30.77 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  25.78 
 
 
391 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  27.59 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  34.25 
 
 
340 aa  95.9  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  31.67 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  32.31 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  33.09 
 
 
377 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  30.64 
 
 
363 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  29.21 
 
 
398 aa  87  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  26.65 
 
 
390 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  33.62 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  25.91 
 
 
480 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  25.7 
 
 
470 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  24.71 
 
 
467 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  30.22 
 
 
431 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  25.3 
 
 
462 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  31.2 
 
 
455 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  31.5 
 
 
495 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  24.15 
 
 
535 aa  43.5  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  29.51 
 
 
436 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  23.42 
 
 
455 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>