85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4312 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  742    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  79.05 
 
 		 377 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  52.62 
 
 		 353 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  52.43 
 
 		 402 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  50.13 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  49.45 
 
 		 362 aa  363  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  50.81 
 
 		 369 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  51.06 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  49.19 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  50.14 
 
 		 351 aa  336  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  48.79 
 
 		 356 aa  335  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  47.43 
 
 		 367 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  46.98 
 
 		 348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  47.8 
 
 		 345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  46.3 
 
 		 354 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  48.06 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  46.94 
 
 		 349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  42.7 
 
 		 375 aa  278  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  41.94 
 
 		 376 aa  275  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  40.88 
 
 		 373 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  42.97 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  44.24 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  40.48 
 
 		 367 aa  236  6e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  39.53 
 
 		 410 aa  234  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  39.34 
 
 		 359 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  39.34 
 
 		 359 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  39.06 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  41.14 
 
 		 345 aa  225  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  41.73 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  38.71 
 
 		 398 aa  222  8e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  40.86 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  36.86 
 
 		 363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  38.54 
 
 		 356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  30.59 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  32.53 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  31.98 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  34.59 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  33.43 
 
 		 390 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  33.14 
 
 		 361 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  32.26 
 
 		 351 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  35.69 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  30.36 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  29.53 
 
 		 320 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  30.46 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  30.49 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  32.12 
 
 		 493 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  28.16 
 
 		 447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  37.6 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  24.47 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  25.92 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  26.63 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  24.74 
 
 		 502 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  26.23 
 
 		 484 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  25.13 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  25.98 
 
 		 455 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  24.6 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  27.42 
 
 		 502 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1915  hypothetical protein  33.98 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  24.87 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  26.25 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  25.77 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  25.32 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  26.94 
 
 		 479 aa  99.4  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  27.82 
 
 		 508 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  25.59 
 
 		 467 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  27.46 
 
 		 480 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  25 
 
 		 486 aa  94.4  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  25.95 
 
 		 466 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  28.48 
 
 		 472 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  24.74 
 
 		 495 aa  89.4  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  24.61 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  25.15 
 
 		 470 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  25.95 
 
 		 477 aa  86.3  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  26.17 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  25.42 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  23.61 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  25.08 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  24.53 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  24.22 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  24.22 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  23.71 
 
 		 506 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  27.03 
 
 		 541 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  27.12 
 
 		 581 aa  73.6  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  24.86 
 
 		 592 aa  61.6  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  22.45 
 
 		 535 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>