74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3490 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1004    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  54.45 
 
 		 462 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  55.37 
 
 		 465 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  55.75 
 
 		 463 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  55.75 
 
 		 463 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  55.78 
 
 		 463 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  59.95 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  52.6 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  55.14 
 
 		 470 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  48.26 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  45.79 
 
 		 466 aa  415  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  45.89 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  46.11 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  44.89 
 
 		 495 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  45.35 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  45.71 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  49 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  43.89 
 
 		 447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  45.68 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  48.28 
 
 		 493 aa  335  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  46.27 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  42.67 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  44.55 
 
 		 502 aa  331  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  42.57 
 
 		 452 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  42.67 
 
 		 508 aa  327  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  45.52 
 
 		 427 aa  323  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  43.92 
 
 		 414 aa  322  9.000000000000001e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  42.69 
 
 		 411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  42.15 
 
 		 537 aa  313  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  44.34 
 
 		 502 aa  310  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  41.8 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  41.09 
 
 		 477 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  40 
 
 		 486 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  42.46 
 
 		 466 aa  283  6.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  35.94 
 
 		 535 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  32.55 
 
 		 541 aa  204  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  35.48 
 
 		 592 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  43.08 
 
 		 581 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  23.38 
 
 		 353 aa  88.6  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  22.8 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  25.75 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  26.05 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  26.44 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  25.99 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  23.71 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  21.43 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  21.59 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  21.23 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  21.56 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  23.53 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  25.89 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  24.91 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  24.04 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  22.08 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  23.28 
 
 		 355 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  23.34 
 
 		 367 aa  67  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  23.23 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  24.33 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  21.15 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  23.13 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  22.9 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  22.07 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  22.56 
 
 		 373 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  22.1 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  21.4 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  20.97 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  21.83 
 
 		 385 aa  51.6  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  25.42 
 
 		 320 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  20.8 
 
 		 370 aa  48.5  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  24.38 
 
 		 365 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  23.62 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  27.64 
 
 		 345 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  30.51 
 
 		 315 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>