85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4508 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  769    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  67.49 
 
 
353 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  68.39 
 
 
402 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  62.88 
 
 
362 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  64.27 
 
 
369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  52.34 
 
 
377 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  50.79 
 
 
373 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  52.91 
 
 
367 aa  362  9e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  51.37 
 
 
355 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  50 
 
 
356 aa  341  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  50.68 
 
 
351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  49.05 
 
 
356 aa  335  7.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  48.76 
 
 
348 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  50.28 
 
 
337 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  49.06 
 
 
349 aa  318  9e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  45.05 
 
 
345 aa  315  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  46.79 
 
 
354 aa  305  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  44.81 
 
 
375 aa  299  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  44.02 
 
 
376 aa  299  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  47.51 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01200  hypothetical protein  42.15 
 
 
410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  40.37 
 
 
367 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  40.92 
 
 
359 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  40.92 
 
 
359 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  40.92 
 
 
359 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  43.17 
 
 
353 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  40.59 
 
 
373 aa  245  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  39.36 
 
 
363 aa  235  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  39.84 
 
 
365 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5379  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  222  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392242 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  39.67 
 
 
363 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  35.71 
 
 
391 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  34.75 
 
 
390 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  38.57 
 
 
345 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  34.31 
 
 
361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  36.12 
 
 
398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  31.97 
 
 
388 aa  210  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  33.97 
 
 
396 aa  202  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  32.98 
 
 
370 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  33.97 
 
 
351 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  34.15 
 
 
340 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  30 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  31.23 
 
 
315 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  30.39 
 
 
320 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  30.75 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2922  hypothetical protein  29.28 
 
 
320 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  30.4 
 
 
493 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  28.62 
 
 
452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  25.41 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1915  hypothetical protein  32.08 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  26.13 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  26.2 
 
 
427 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  26.87 
 
 
411 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  24.53 
 
 
414 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  24.08 
 
 
483 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  24.33 
 
 
436 aa  106  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  23.77 
 
 
455 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  25.93 
 
 
456 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  23.42 
 
 
502 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  24.87 
 
 
431 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  28 
 
 
455 aa  103  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  23.78 
 
 
467 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  25.07 
 
 
495 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  24.1 
 
 
470 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  27.17 
 
 
537 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  24.92 
 
 
480 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  26.79 
 
 
479 aa  97.1  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  25.95 
 
 
508 aa  96.3  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  24.6 
 
 
466 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  24.43 
 
 
463 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  22.67 
 
 
445 aa  93.2  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  22.99 
 
 
462 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  24.15 
 
 
465 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  24.43 
 
 
463 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  24.43 
 
 
463 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  24.55 
 
 
477 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  24.73 
 
 
472 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  25.26 
 
 
466 aa  87.4  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  25.26 
 
 
502 aa  86.7  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  22.87 
 
 
486 aa  86.7  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  23.2 
 
 
506 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  22.71 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  25 
 
 
592 aa  77.8  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  26.7 
 
 
581 aa  71.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  21.3 
 
 
535 aa  62.8  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>