78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0111 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  100 
 
 
581 aa  1172    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  66.27 
 
 
592 aa  356  5.999999999999999e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  34.73 
 
 
486 aa  229  8e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  32.78 
 
 
477 aa  212  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  32.23 
 
 
455 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  31.61 
 
 
452 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  50.27 
 
 
508 aa  191  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  46.94 
 
 
436 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  47.18 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  42.28 
 
 
470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  41.7 
 
 
502 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  46.31 
 
 
479 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  44.67 
 
 
431 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  44.98 
 
 
483 aa  171  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  45.13 
 
 
480 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  44.98 
 
 
502 aa  170  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  44.28 
 
 
456 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  36.97 
 
 
411 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  44.22 
 
 
495 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  41.7 
 
 
467 aa  167  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  40.56 
 
 
447 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  45.64 
 
 
493 aa  166  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  42.24 
 
 
445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  44.44 
 
 
472 aa  164  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  43.94 
 
 
463 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  43.94 
 
 
463 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  45.23 
 
 
414 aa  163  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  43.94 
 
 
463 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  44.22 
 
 
484 aa  162  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  44.9 
 
 
465 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  45.3 
 
 
462 aa  160  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  41.32 
 
 
537 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  40.08 
 
 
541 aa  156  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  46.49 
 
 
455 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  44.72 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  41.75 
 
 
506 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  35 
 
 
535 aa  139  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  41.67 
 
 
466 aa  136  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  28.19 
 
 
377 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  26.11 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  26.59 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  27.12 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  25.28 
 
 
356 aa  72  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  26.7 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  25.43 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  25.56 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  25.56 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  27.13 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  26.74 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  25 
 
 
353 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  26.63 
 
 
367 aa  62.4  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  25.82 
 
 
367 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  21.51 
 
 
362 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  28.32 
 
 
369 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  24.44 
 
 
340 aa  57.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  25.58 
 
 
354 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  21.5 
 
 
388 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  25.73 
 
 
385 aa  55.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  26.11 
 
 
363 aa  55.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  21.79 
 
 
361 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  24.31 
 
 
396 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  24.58 
 
 
348 aa  54.3  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  21.79 
 
 
390 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  20.66 
 
 
391 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  22.38 
 
 
373 aa  51.6  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  22.22 
 
 
376 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  27.27 
 
 
345 aa  50.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  21.11 
 
 
375 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  21.51 
 
 
351 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  25.15 
 
 
317 aa  47  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  24.08 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  24.08 
 
 
359 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  24.08 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  24.46 
 
 
320 aa  46.2  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  23.33 
 
 
315 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  26.32 
 
 
366 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  20.1 
 
 
398 aa  43.9  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  22.81 
 
 
370 aa  43.5  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>