82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4656 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  81.9 
 
 
463 aa  732    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  75.22 
 
 
472 aa  686    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  921    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  80.57 
 
 
463 aa  713    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  90.83 
 
 
465 aa  836    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  81.9 
 
 
463 aa  732    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3040  hypothetical protein  56.61 
 
 
445 aa  508  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3490  hypothetical protein  53.62 
 
 
506 aa  492  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0668843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  53.86 
 
 
470 aa  458  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0938  hypothetical protein  51.66 
 
 
480 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1596  hypothetical protein  50.23 
 
 
466 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4224  hypothetical protein  49.67 
 
 
455 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2956  hypothetical protein  47.58 
 
 
436 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0536  hypothetical protein  46.19 
 
 
467 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460956  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3732  hypothetical protein  46.22 
 
 
456 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.126372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  45.5 
 
 
484 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  43.43 
 
 
495 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3786  hypothetical protein  42.41 
 
 
455 aa  348  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0650027  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  46.34 
 
 
427 aa  346  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2751  hypothetical protein  45.63 
 
 
483 aa  345  8.999999999999999e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.581922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2473  hypothetical protein  44.64 
 
 
502 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000330545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  45.07 
 
 
447 aa  341  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4379  hypothetical protein  44.56 
 
 
414 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0940  hypothetical protein  43.55 
 
 
452 aa  335  7.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8347  hypothetical protein  50.27 
 
 
431 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  45.79 
 
 
493 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  41.31 
 
 
411 aa  323  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7933  hypothetical protein  44.16 
 
 
537 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27510  hypothetical protein  41.76 
 
 
508 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0721  hypothetical protein  42.12 
 
 
486 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2890  hypothetical protein  41.37 
 
 
502 aa  306  6e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0791  hypothetical protein  41.8 
 
 
477 aa  299  9e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2464  hypothetical protein  39.74 
 
 
479 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  hitchhiker  0.000101196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15030  hypothetical protein  39.77 
 
 
466 aa  280  5e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19090  hypothetical protein  37.59 
 
 
535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0288289  normal  0.173711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11450  hypothetical protein  36.27 
 
 
541 aa  233  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0899077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0446  putative hydrolase  34.2 
 
 
592 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0111  hypothetical protein  45.3 
 
 
581 aa  159  7e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  24.8 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0830  hypothetical protein  27.67 
 
 
345 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.967672  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0613  hypothetical protein  25.48 
 
 
355 aa  95.1  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4508  hypothetical protein  22.99 
 
 
381 aa  87.8  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  25.48 
 
 
367 aa  86.7  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9178  hypothetical protein  24.69 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4749  hypothetical protein  27.41 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1626  hypothetical protein  21.97 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2266  hypothetical protein  21.61 
 
 
390 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0500775  hitchhiker  0.000106543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0309  hypothetical protein  27.16 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4311  hypothetical protein  26.64 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1384  hypothetical protein  22.39 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  24.83 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4312  hypothetical protein  25.08 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658784  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4967  hypothetical protein  21.47 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1124  hypothetical protein  21.63 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0845  hypothetical protein  27.91 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2102  hypothetical protein  25.41 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.584193  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0440  hypothetical protein  22.31 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0835114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8429  hypothetical protein  22.79 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35720  hypothetical protein  25.64 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48876  normal  0.527385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2898  hypothetical protein  23.26 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5822  hypothetical protein  23 
 
 
351 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0117059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3659  hypothetical protein  21 
 
 
391 aa  67  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000101981  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0148  hypothetical protein  22.15 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0309  hypothetical protein  22.6 
 
 
376 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32120  hypothetical protein  24.43 
 
 
367 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1986  hypothetical protein  23 
 
 
340 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0869886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0554  hypothetical protein  25 
 
 
345 aa  63.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.477816  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2107  hypothetical protein  22.87 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4021  hypothetical protein  25.69 
 
 
373 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0624  hypothetical protein  26.17 
 
 
363 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4863  hypothetical protein  22.76 
 
 
359 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4777  hypothetical protein  22.76 
 
 
359 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.669398  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5163  hypothetical protein  22.76 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0679  hypothetical protein  24.16 
 
 
315 aa  59.3  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2233  hypothetical protein  24.81 
 
 
366 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.442538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  26.26 
 
 
365 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1065  hypothetical protein  23.23 
 
 
320 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0528  hypothetical protein  27.97 
 
 
385 aa  53.5  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0954462  normal  0.0231412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1410  hypothetical protein  21.43 
 
 
363 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2990  hypothetical protein  24.75 
 
 
398 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13657  hypothetical protein  22.96 
 
 
353 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255081  hitchhiker  0.0000368151 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1915  hypothetical protein  25.3 
 
 
325 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>