More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3613 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3613  ABC transporter related protein  100 
 
 		 602 aa  1130    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.956845  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0535  ABC transporter related protein  48.49 
 
 		 569 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4243  ABC transporter related  47.72 
 
 		 609 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1319  ABC transporter related  41.73 
 
 		 564 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6439  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 310 aa  272  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0973055  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0473  ATPase  41.83 
 
 		 588 aa  152  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.44 
 
 		 577 aa  144  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4953  ABC transporter related  34.68 
 
 		 683 aa  144  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  40.83 
 
 		 595 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  39.92 
 
 		 595 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  38.98 
 
 		 1218 aa  140  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  39.92 
 
 		 595 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  36.17 
 
 		 737 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  39.11 
 
 		 1218 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  38.56 
 
 		 599 aa  137  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  34.4 
 
 		 588 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  39.92 
 
 		 593 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 571 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 594 aa  136  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  28.29 
 
 		 609 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  39.66 
 
 		 581 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  24.95 
 
 		 582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  23.42 
 
 		 597 aa  135  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  37.01 
 
 		 627 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1653  lantibiotic transporter containing removal activity of leader peptide  28.46 
 
 		 745 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  39.02 
 
 		 1230 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2983  ABC transporter related  37.54 
 
 		 653 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  38.71 
 
 		 589 aa  134  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  34.44 
 
 		 584 aa  134  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.75 
 
 		 596 aa  133  7.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  43.28 
 
 		 1436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0869  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 564 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.829342 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.87 
 
 		 626 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  34.44 
 
 		 573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  40.32 
 
 		 617 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  32.91 
 
 		 747 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  34.44 
 
 		 573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  35.71 
 
 		 593 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0822  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  35.68 
 
 		 579 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702953  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 613 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  41.85 
 
 		 608 aa  130  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  35.93 
 
 		 587 aa  130  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  28.12 
 
 		 581 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.45 
 
 		 589 aa  130  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  39.09 
 
 		 598 aa  130  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.93 
 
 		 588 aa  130  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.48 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  38.05 
 
 		 618 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  23.89 
 
 		 579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  40 
 
 		 635 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.78 
 
 		 1257 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.06 
 
 		 579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  26.99 
 
 		 590 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.66 
 
 		 596 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.64 
 
 		 608 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.1 
 
 		 1091 aa  128  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0697  ABC transporter, transmembrane region, type 1  35.2 
 
 		 574 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  36.76 
 
 		 614 aa  127  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  31.36 
 
 		 578 aa  127  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  37.02 
 
 		 586 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  36.36 
 
 		 599 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  31.36 
 
 		 578 aa  127  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  40.91 
 
 		 593 aa  127  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  35.51 
 
 		 782 aa  127  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.2 
 
 		 580 aa  127  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  40.97 
 
 		 1284 aa  127  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  38.7 
 
 		 1228 aa  127  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4862  ABC transporter related  40.34 
 
 		 599 aa  127  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.45 
 
 		 627 aa  126  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1787  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.48 
 
 		 582 aa  126  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  38.1 
 
 		 613 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  37.8 
 
 		 600 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.79 
 
 		 629 aa  126  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25 
 
 		 571 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.44 
 
 		 1024 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25 
 
 		 571 aa  126  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  39.48 
 
 		 593 aa  126  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.15 
 
 		 577 aa  126  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  28.6 
 
 		 589 aa  126  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.22 
 
 		 579 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.8 
 
 		 571 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3689  ABC transporter related  29.59 
 
 		 637 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  33.07 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 609 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 615 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2098  ABC transporter related  37.5 
 
 		 609 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  38.4 
 
 		 611 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  32.48 
 
 		 760 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  37.19 
 
 		 572 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  24.69 
 
 		 571 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0821  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  35.46 
 
 		 574 aa  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.17374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  34.78 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  36.97 
 
 		 1205 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  37.4 
 
 		 719 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.41 
 
 		 574 aa  124  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  39.22 
 
 		 590 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  36.55 
 
 		 671 aa  125  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  24.63 
 
 		 575 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  37.55 
 
 		 589 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>